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Enregistrement W2594998925 · doi:10.3389/fnhum.2017.00033

Prediction of Mild Cognitive Impairment Conversion Using a Combination of Independent Component Analysis and the Cox Model

2017· article· en· W2594998925 sur OpenAlexfundno aff
Ke Liu, Kewei Chen, Yao Li, Xiaojuan Guo

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Human Neuroscience · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SServierNational Natural Science Foundation of ChinaEisaiGenentechIXICONorthern California Institute for Research and EducationUniversity of California, San DiegoPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNeuroimagingProportional hazards modelHazard ratioPositron emission tomographyMagnetic resonance imagingTemporal lobeInternal medicineDefault mode networkMultivariate statisticsConfidence intervalPsychologyMedicineAlzheimer's diseaseCognitionDiseaseNuclear medicineNeuroscienceRadiologyComputer scienceMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mild cognitive impairment (MCI) represents a transitional stage from normal aging to Alzheimer's disease (AD) and corresponds to a higher risk of developing AD. Thus, it is necessary to explore and predict the onset of AD in MCI stage. In this study, we propose a combination of independent component analysis (ICA) and the multivariate Cox proportional hazards regression model to investigate promising risk factors associated with MCI conversion among 126 MCI converters and 108 MCI non-converters from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) database. Using structural magnetic resonance imaging (MRI) and fluorodeoxyglucose positron emission tomography (FDG-PET) data, we extracted brain networks from AD and normal control groups via ICA and then constructed Cox models that included network-based neuroimaging factors for the MCI group. We carried out five separate Cox analyses and the two-modality neuroimaging Cox model identified three significant network-based risk factors with higher prediction performance (accuracy = 73.50%) than those in either single-modality model (accuracy = 68.80%). Additionally, the results of the comprehensive Cox model, including significant neuroimaging factors and clinical variables, demonstrated that MCI individuals with reduced gray matter volume in a temporal lobe-related network of structural MRI [hazard ratio (HR) = 8.29E-05 (95% confidence interval (CI), 5.10E- 07 ~ 0.013)], low glucose metabolism in the posterior default mode network based on FDG-PET [HR = 0.066 (95% CI, 4.63E-03 ~ 0.928)], positive apolipoprotein E ε4-status [HR = 1. 988 (95% CI, 1.531 ~ 2.581)], increased Alzheimer's Disease Assessment Scale-Cognitive Subscale scores [HR = 1.100 (95% CI, 1.059 ~ 1.144)] and Sum of Boxes of Clinical Dementia Rating scores [HR = 1.622 (95% CI, 1.364 ~ 1.930)] were more likely to convert to AD within 36 months after baselines. These significant risk factors in such comprehensive Cox model had the best prediction ability (accuracy = 84.62%, sensitivity = 86.51%, specificity = 82.41%) compared to either neuroimaging factors or clinical variables alone. These results suggested that a combination of ICA and Cox model analyses could be used successfully in survival analysis and provide a network-based perspective of MCI progression or AD-related studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil0,469

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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