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Enregistrement W2595344773 · doi:10.1093/biolreprod/81.s1.359

Tissue Specific Transcription Start Site and Alternative Splicing of the MAESTRO Gene (MRO): in Granulosa Cells from PCOS and Non-PCOS Patients, and in Control Non-Ovarian Tissues.

2009· article· en· W2595344773 sur OpenAlexaff
Shlomit Kenigsberg, Rodica Mandel, Hanna Bałakier, Vera Radunovic, Clifford Librach

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensCReATe Fertility Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGranulosa cellAlternative splicingGeneFollicular phaseOvarian follicleExonMolecular biologyAndrologyEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MRO, whose gene product and function remains unknown, was first described during male murine gonadal somatic cell differentiation, but not in the developing female gonads. We previously showed that MRO has a remarkable over expression in granulosa cells from lean patients with Polycystic Ovarian Syndrome (PCOS). The aim of the study was to 1) investigate the different splice variants expression patterns of the MRO gene in human ovarian granulosa cells from PCOS and non-PCOS patients. 2) To characterize tissue specific transcription start sites of the human MRO gene. 3) To isolate the MRO protein from human tissues. The project was approved by the Research Ethics board of Sunnybrook Health Sciences Centre and all participants provided informed consent. Total RNA was isolated from granulosa lutein cells obtained from patients undergoing in vitro fertilization (IVF) and from other commercially acquired human tissues. Gene expression was analyzed by RT-PCR. Whole protein extracts from granulosa cells were resolved by SDS-PAGE and analyzed by Western blot using a polyclonal antibody raised against the deduced peptide. The presence of multiple splice variants in several human tissues was demonstrated using RT-PCR. A unique MRO transcript containing the non-coding exon 1 was found exclusively in GLC and testis, but not in other tissues. The two main variants were cloned into an expression vector in order to express the protein in a cell-free system. Western blot analysis on whole protein extracts from granulosa cells revealed two bands -- 29kDa and 26kDa). The 26kDa appeared also with the expression vector analysis. In conclusion, we show evidence that a unique transcript of the human MRO gene, containing the non-coding region of exon 1, but not exon 2, is expressed in human adult granulosa lutein cells and testis but not in other tissues. The transcript containing exon 1 encodes an alternative promoter which may serve as a tissue-specific regulatory sequence. We are currently attempting to express and purify the different protein isoforms. This contributes to our previous findings of differential MRO expression in human cumulus cells from lean PCOS patients undergoing IVF compared to their non-PCOS counterparts. Further studies of MRO may reveal novel processes involved in both normal ovarian physiology and in PCOS. (poster)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,324
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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