Characterization of the Mouse Kcnq1ot1 Non-Coding RNA.
Notice bibliographique
Résumé
For a small group of important developmental genes, there is preferential silencing of either the maternal or paternal allele during development. This process of preferential expression is called "genomic imprinting." Imprinted genes often cluster in imprinted domains. Interestingly, these imprinting domains are associated with a non-coding RNA (ncRNA) that may regulate imprinted gene expression across the entire domain. Disruptions in imprinting can have severe consequences for growth and development. In humans, this can result in the development of imprinting disorders such as Beckwith-Wiedemann Syndrome (BWS). BWS is an overgrowth disorder caused by loss of maternal methylation at the KCNQ1OT1 gene. This leads to maternal activation of the normally paternally expressed KCNQ1OT1 ncRNA, and loss of expression of eight maternally expressed protein-coding genes. To understand the complex regulation of genomic imprinting, studies are required to determine how early embryos set up a hierarchy of events that will establish imprinting across large chromosomal domains. Because of the association of ncRNAs with imprinting domains, it is important to elucidate their characteristics and modes of action. The goal of this project is to characterize the mouse Kcnq1ot1 ncRNA and its role in imprinted gene regulation, specifically during preimplantation development. Our findings indicate that the Kcnq1ot1 ncRNA terminates at 462 kb from the transcriptional start site and that this length is conserved in various tissues and developmental stages. This suggests that the boundary between the Kcnq1ot1 and H19 domains resides downstream of Th between 463 and 617 kb, extending the Kcnq1ot1 domain boundary to a region between Th and Ins2, instead of between Ascl2 and Ins2 as previously suggested. shRNA and siRNA targeted disruption of the transcript at 43 kb and 461 kb, respectively, suggests that Kcnq1ot1 is one continuous transcript as opposed to having multiple start sites along the length. In addition, the Kcnq1ot1 transcript originates from the imprinting centre (IC), as deletion of the paternal IC, which contains the Kcnq1ot1 promoter, results in loss of amplification along the length of the transcript. Results from the proposed study will lead to a better understanding of the role that long ncRNAs play in establishing and/or maintaining imprinted gene regulation across imprinting domains, as well as their role in human imprinted disorders. (platform)
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».