Ankyrin repeat and zinc-finger domain-containing 1 mutations are associated with infantile-onset inflammatory bowel disease
Notice bibliographique
Résumé
Infantile-onset inflammatory bowel disease (IO IBD) is an invalidating illness with an onset before 2 years of age and has a complex pathophysiology in which genetic factors are important. Homozygosity mapping and whole-exome sequencing in an IO IBD patient and subsequent sequencing of the candidate gene in 12 additional IO IBD patients revealed two patients with two mutated ankyrin repeat and zinc-finger domain-containing 1 ( ANKZF1 ) alleles (homozygous ANKZF1 R585Q mutation and compound heterozygous ANKZF1 E152K and V32_Q87del mutations, respectively) and two patients with one mutated ANKZF1 allele. Although the function of ANKZF1 in mammals had not been previously evaluated, we show that ANKZF1 has an indispensable role in the mitochondrial response to cellular stress. ANKZF1 is located diffusely in the cytoplasm and translocates to the mitochondria upon cellular stress. ANKZF1 depletion reduces mitochondrial integrity and mitochondrial respiration under conditions of cellular stress. The ANKZF1 mutations identified in IO IBD patients with two mutated ANKZF1 alleles result in dysfunctional ANKZF1, as shown by an increased level of apoptosis in patients' lymphocytes, a decrease in mitochondrial respiration in patient fibroblasts with a homozygous ANKZF1 R585Q mutation, and an inability of ANKZF1 R585Q and E152K to rescue the phenotype of yeast deficient in Vms1, the yeast homologue of ANKZF1. These data indicate that loss-of-function mutations in ANKZF1 result in deregulation of mitochondrial integrity, and this may play a pathogenic role in the development of IO IBD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».