Genetic Diversity of Moroccan Orobanche crenata Populations Revealed by Sequence-Related Amplified Polymorphism Markers
Notice bibliographique
Résumé
Orobanche crenata Forsk. is a root holoparasitic plant that affects legume species in Mediterranean basin especially in Northern Africa. This parasitic weed is particularly problematic in faba bean (Vicia faba L.) and lentil (Lens culinaris Medik.) fields. In Morocco, development of legume resistant/tolerant genotypes is considered the most economical and ecological control strategy against O. crenata. Efficient selection of resistant/tolerant cultivars requires prerequisite knowledge of the genetic diversity of the parasite. Thus, the present study focused on the assessment of the genetic diversity among and within Moroccan O. crenata populations, growing in faba bean fields, using Sequence-Related Amplified Polymorphism markers (SRAP). This marker system proved to be a powerful and an efficient tool for the evaluation of the genetic diversity among O. crenata populations. In fact, a total of 101 markers were identified and used for the Analysis of Molecular Variance (AMOVA), among which 98 bands were polymorphic (97.02%), indicating considerable genetic variation of these O. crenata populations. However, at population level, low level of polymorphic loci was observed with a percentage ranging between 41.58% and 67.33%. The Jaccard’s similarity coefficient and Principal Coordinate Analysis (PCoA) showed a clear differentiation among O. crenata samples according to the geographical origin of each population. AMOVA analysis revealed also a large extent of variation among O. crenata populations (60%; p < 0.010). Our outputs on molecular genetics of O. crenata combined with future epidemiological studies of these populations should clarify occurrence of O. crenata pathotypes and thereby validate the relevance of using multisite screening trials during breeding programs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».