Intraspecific Variation in the Populus balsamifera Drought Response: A Systems Biology Approach
Notice bibliographique
Résumé
As drought can impinge significantly on forest health and productivity, the mechanisms by which forest trees respond to drought is of interest. The research presented herein examined the intra-specific variation in the Populus balsamifera drought response, examining the potential role of the transcriptome to configure growth, metabolism and development in response to water deficit. Amassing evidence indicates that different species of Populus have divergent mechanisms and Three lines of inquiry were pursued to investigate the intraspecific variation the drought response in P. balsamifera.\nFirst, the transcriptome responses of six genotypes of P. balsamifera were examined using Affymetrix Poplar GeneChips under well-watered and water-deficit conditions. A core species-level transcriptome response was identified. Significantly, intraspecific variation in the drought transcriptome was also identified. The data support a role for genotype-derived variation in the magnitude of P. balsamifera transcriptome remodelling playing a role in conditioning drought responsiveness.\nSecond, the impact of drought-stress induced declines in stomatal conductance, as well as an alteration in stomatal development in two genotypes was examined. Patterns of transcript abundance of genes hypothesised to underpin stomatal development had patterns congruent with their role in modulation of stomatal development. These results suggest that stomatal development may play a role as a long-term mechanism to limit water loss from P. balsamifera leaves under conditions of drought-stress.\nFinally, the drought-induced metabolome of six P. balsmaifera genotypes was interrogated. Metabolite profiling reveled amino acids such as isoleucine and proline and sugars such as galactinol and raffinose were found with increased abundance, whereas TCA intermediates succinic and malic acid were found with decreased abundance in response to drought. Comparative analysis of the metabolome and the transcriptome revealed genotypic-specific variation in energy and carbohydrate metabolism.\nTaken together, the findings reported in this thesis form a foundation to understand the basis of intraspecific variation in the drought response in P. balsamifera. Transcripts and metabolites that contribute to within-species differences in drought tolerance were defined. These molecular components are useful targets for both future study, as well as efforts aimed at protecting and growing trees of this important species under challenging environmental conditions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».