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Enregistrement W2596929631 · doi:10.1177/1947603517690856

Simple Silica Column–Based Method to Quantify Inorganic Polyphosphates in Cartilage and Other Tissues

2017· article· en· W2596929631 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCartilage · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensStem Cell NetworkUniversity of OttawaUniversity of TorontoToronto Centre for PhenogenomicsLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésColumn chromatographyChromatographyChemistryFluorescenceElutionPolyphosphateDAPICartilageBiochemistryBiologyAnatomyPhosphate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective. Inorganic polyphosphates (polyP) play a multitude of roles in mammalian biology. PolyP research is hindered by the lack of a simple and sensitive quantification method. The aim of this study was to develop a robust method for quantifying the low levels of polyP in mammalian tissue such as cartilage, which is rich in macromolecules that interfere with its determination. Design. Native and in vitro formed tissues were digested with proteinase K to release sequestrated polyP. The tissue digest was loaded on to silica spin columns, followed by elution of bound polyP and various treatments were assessed to minimize non-polyP fluorescence. The eluent was then quantified for polyP content using fluorometry based on DAPI (4′,6-diamidino-2-phenylindole) fluorescence shift occurring with polyP. Results. Proteinase K pretreatment reduced the inhibitory effect of proteins on polyP recovery. The eluent was contaminated with nucleic acids and glycosaminoglycans, which cause extraneous fluorescence signals. These were then effectively eliminated by nucleases treatment and addition of concentrated Tris buffer. PolyP levels were quantified and recovery ratio determined using samples spiked with a known amount of polyP. This silica spin column method was able to recover at least 80% of initially loaded polyP, and detect as little as 10 −10 mol. Conclusions. This sensitive, reproducible, easy to do method of quantifying polyP will be a useful tool for investigation of polyP biology in mammalian cells and tissues. Although the protocol was developed for mammalian tissues, this method should be able to quantify polyP in most biological sources, including fluid samples such as blood and serum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,326
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle