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Enregistrement W2597326615 · doi:10.1093/biolreprod/78.s1.300e

AGPAT1, a New Histone Acetyltransferase During Spermatogenesis.

2008· article· en· W2597326615 sur OpenAlexaff
Guylain Boissonneault, Marilyne Joly, Frédéric Leduc, Jessica Leroux, Vincent Maquennehan, Geneviève Bikond Nkoma

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySpermatogenesisHistone acetyltransferaseHistoneCell biologyGeneticsEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Male infertility is often associated with a relatively high DNA fragmentation level and an altered or incomplete chromatin packaging in mature spermatozoa. Spermatozoa acquire their unique chromatin packaging during the haploid phase of spermatogenesis, termed spermiogenesis. Hyperacetylation of histones H3 and H4 participates in this transition from a somatic histone organization to the compact protamined DNA found in spermatozoa. Because the control of histone acetylation is important for the genetic integrity of spermatids, we seek to identify new potential histone acetyltransferases (HATs) involved in this process using a functional assay. Since HATs bind covalently to their substrates, we hypothesize that new histone acetyltransferases may be identified by their interaction with hyperacetyled histones H4. We immunoprecitated hyperacetylated histone H4 from nuclear extracts from sonication resistant spermatids. To identify the molecular weight of co-immunoprecipitated HATs, we carried out in-gel HAT assays. Gel slices corresponding to a strong activity signal were cut out, and proteins identified by mass spectrometry. Cellular localization of the candidate was verified by immunofluorescence. The recombinant candidate protein was expressed and purified from E. coli JC201 cells and its in vitro histone acetyltransferase activity was assessed. A 70 kDa protein complex harboring an histone acetyltransferase activity was found associated with hyperacetylated histone H4. From mass spectrometry analysis of this band, we identified as a potential candidate AGPAT1 (1-acyl sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1), an acyltransferase normally involved in phospholipids metabolism in somatic cells. Using immunofluorescence, AGPAT1 localized to the nucleus of elongating spermatids and the recombinant protein acetylated histones in vitro. Around 6 % of mammalian cell phospholipids is retained within the nuclear matrix providing substrate for lipid-mediated signaling events. Ten percent of nuclear phospholipids are associated with chromatin in somatic cells. The particular features conferring nuclear confinement of AGPAT1 in spermatids also remains to be elucidated but may be related to the relatively high lipids metabolism of the developing sperm head. That an acyltransferase may operate as an HAT during the chromatin remodeling is an original finding that may, for the first time, link lipid metabolism to the control of chromatin dynamics in the male gamete and could potentially be extended to somatic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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