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Enregistrement W2597350093 · doi:10.1139/cjc-2016-0604

Can THF hydrogen bond to glycine as strong as water?

2017· article· en· W2597350093 sur OpenAlexvenueno aff
Damanjit Kaur, Geetanjali Chopra, Rajinder Kaur

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCrystallography and molecular interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryNatural bond orbitalHydrogen bondLow-barrier hydrogen bondComputational chemistryInteraction energyMoleculeConformational isomerismDensity functional theoryAtoms in moleculesAb initioLone pairBond-dissociation energyCrystallographyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hydrogen bond complexation between glycine and THF and between glycine and water involving four lowest-energy glycine conformers have been studied. The complexes have been investigated in the gas phase at the ab initio molecular orbital theory (MP2) with aug-cc-pVDZ basis set and density functional theory (B3LYP) with aug-cc-pVTZ basis set. Bader’s theory of atoms in molecules (AIM), natural bond orbital (NBO), and symmetry adapted perturbation theory (SAPT) analyses are employed to elucidate the interaction characteristics in the complexes. The premise that the hydrogen bond donor ability of the O–H group of the carboxyl group dominates the interaction between glycine and THF and between glycine and water is confirmed. It is found that in comparison with water, THF binds more strongly to glycine. The quantum studies indicate that contribution of N–H···O and C–H···O hydrogen bonds in the complexes, although lower in magnitude to O–H···O interactions, play an important role in the stability of complexes. The blue and red shifts in the stretching frequencies of the hydrogen bond donors X–H (X = O, C, N) have also been related to stabilization energies. Decomposition of the stabilization energy based on the SAPT method clearly indicates the dominant role of the electrostatic interactions in all the complexes under study; however, induction and dispersion interaction terms are relatively higher in glycine–THF complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,139
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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