MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2597879187 · doi:10.1038/srep45403

Time- and dose dependent actions of cardiotonic steroids on transcriptome and intracellular content of Na+ and K+: a comparative analysis

2017· article· en· W2597879187 sur OpenAlexaff
Е. А. Климанова, Artem M. Tverskoi, С. В. Кольцова, Svetlana V. Sidorenko, O. D. Lopina, Johanne Tremblay, Pavel Hamet, Л. В. Капилевич, Sergei N. Orlov

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesRussian Science FoundationRussian Foundation for Basic Research
Mots-clésTranscriptomeIntracellularPharmacologyChemistryComputer scienceCell biologyComputational biologyMedicineBiologyBiochemistryGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Recent studies demonstrated that in addition to Na + ,K + -ATPase inhibition cardiotonic steroids (CTSs) affect diverse intracellular signaling pathways. This study examines the relative impact of [Na + ] i /[K + ] i -mediated and -independent signaling in transcriptomic changes triggered by the endogenous CTSs ouabain and marinobufagenin (MBG) in human umbilical vein endothelial cells (HUVEC). We noted that prolongation of incubation increased the apparent affinity for ouabain estimated by the loss of [K + ] i and gain of [Na + ] i . Six hour exposure of HUVEC to 100 and 3,000 nM ouabain resulted in elevation of the [Na + ] i /[K + ] i ratio by ~15 and 80-fold and differential expression of 258 and 2185 transcripts, respectively. Neither [Na + ] i /[K + ] i ratio nor transcriptome were affected by 6-h incubation with 30 nM ouabain. The 96-h incubation with 3 nM ouabain or 30 nM MBG elevated the [Na + ] i /[K + ] i ratio by ~14 and 3-fold and led to differential expression of 880 and 484 transcripts, respectively. These parameters were not changed after 96-h incubation with 1 nM ouabain or 10 nM MBG. Thus, our results demonstrate that elevation of the [Na + ] i /[K + ] i ratio is an obligatory step for transcriptomic changes evoked by CTS in HUVEC. The molecular origin of upstream [Na + ] i /[K + ] i sensors involved in transcription regulation should be identified in forthcoming studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,174
Score d'incertitude au seuil0,278

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetIon Transport and Channel RegulationTravaux en français237 207