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Enregistrement W2598650898 · doi:10.7554/elife.22069

Tracking zoonotic pathogens using blood-sucking flies as 'flying syringes'

2017· article· en· W2598650898 sur OpenAlexfundno aff
Paul-Yannick Bitome-Essono, Benjamin Ollomo, Céline Arnathau, Patrick Durand, Nancy Diamella Mokoudoum, Lauriane Yacka-Mouele, Alain-Prince Okouga, Larson Boundenga, Bertrand Mvé-Ondo, Judicaël Obame‐Nkoghe, Philippe Mbehang-Nguema, Flobert Njiokou, Boris Makanga, Rémi Wattier, Diégo Ayala, Francisco J. Ayala, François Renaud, Virginie Rougeron, François Bretagnolle, Franck Prugnolle, Christophe Paupy

Notice bibliographique

RevueeLife · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgence Universitaire de la FrancophonieCentre International de Recherches Médicales de FrancevilleAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyParasite hostingZoologyExtant taxonMalariaWildlifeVertebrateVector (molecular biology)Plasmodium (life cycle)Human pathogenInfectious disease (medical specialty)VirologyEcologyEvolutionary biologyImmunologyBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

About 60% of emerging infectious diseases in humans are of zoonotic origin. Their increasing number requires the development of new methods for early detection and monitoring of infectious agents in wildlife. Here, we investigated whether blood meals from hematophagous flies could be used to identify the infectious agents circulating in wild vertebrates. To this aim, 1230 blood-engorged flies were caught in the forests of Gabon. Identified blood meals (30%) were from 20 vertebrate species including mammals, birds and reptiles. Among them, 9% were infected by different extant malaria parasites among which some belonged to known parasite species, others to new parasite species or to parasite lineages for which only the vector was known. This study demonstrates that using hematophagous flies as 'flying syringes' constitutes an interesting approach to investigate blood-borne pathogen diversity in wild vertebrates and could be used as an early detection tool of zoonotic pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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