Somatic cell count thresholds in composite and quarter milk samples as indicator of bovine intramammary infection status
Notice bibliographique
Résumé
The objective of the study was to establish an operational somatic cell count (SCC) threshold to predict the presence of intramammary infection (IMI) in composite milk samples and compare findings with those in quarter milk samples. South African dairy producers now preferred composite milk samples for herd udder health analysis because of increasing cow numbers, convenience of sampling and lower cost. A retrospective study was conducted on 345 461 composite and 89 638 quarter milk samples from South African herds. Variance estimates for the proportion of quarter samples testing positive were adjusted to account for the lack of their independence within individual cows. The IMI at SCC thresholds of 150 000 cells/mL and 200 000 cells/mL differed only by 3.26% in composite milk samples. Youden's index indicated the optimum SCC thresholds for composite and quarter milk samples as 150 000 cells/mL and 200 000 cells/mL, respectively. At 150 000 cells/mL, sensitivity (95% confidence intervals [CI]) in composite milk samples was 65.3% (64.0%, 66.6%) and specificity was 66.8% (65.7%, 67.9%); and in quarter milk samples, sensitivity at 200 000 cells/ mL was 70.8% (69.5%, 72.0%) and specificity was 63.6% (62.4%, 64.8%). The likelihood of infection for udders and quarters, respectively, was 1.034 and 1.327 at an SCC threshold of 150 000 cells/mL and 0.864 cells/mL and 1.177 cells/mL at 200 000 cells/mL. The area under the curve of the receiver operating characteristics graph was 0.7084 and 0.7277 for composite and quarter samples, respectively, indicating that the SCC test could be considered as a good indicator of IMI in both sample types.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».