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Enregistrement W2598860788 · doi:10.1200/jco.2013.31.15_suppl.6543

Willingness of patients to provide biologic samples for pharmacogenomic testing.

2013· article· en· W2598860788 sur OpenAlexaffabout
Tenneille Loo, Sinéad Cuffe, Henrique Hon, Petra Martin, M. Catherine Brown, Shabbir M.H. Alibhai, Natasha B. Leighl, Céline Mascaux, Ming‐Sound Tsao, Frances A. Shepherd, Xin Qiu, Wei Xu, Geoffrey Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer CentrePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBiopsyBlood samplingBlood cancerSampling (signal processing)CancerInternal medicineLikert scaleGenetic testingBlood testOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

6543 Background: Additional biopsies and/or blood sampling (i.e.: germline and plasma markers, circulating DNA or tumour cells) may be necessary to complete pharmacogenomic testing (PGT) in some patients. Cancer patients’ perspectives on providing additional biospecimens are important in addressing potential knowledge translation barriers. Methods: 790 clinic patients from the Princess Margaret Cancer Centre (Toronto, Canada) were interviewed with a standardized questionnaire, representing a wide distribution of adult solid and hematological disease sites. Study endpoints included patient preferences and willingness to provide biological samples (new blood, new biopsy, or pre-existing tumor samples) on a 5-point Likert scale. Univariate and multivariate models were created using SAS 9.3. Results: Patients were 49% female; 77% Caucasian/12% Asian; median age 58 years; and 67% had completed high school. Median household income was evenly trichotomized at $50K and $100K. Despite 33% of the patients being uncomfortable with the level of their knowledge about PGT, 75% agreed that additional tests would be beneficial to their health. Patient willingness to provide new samples was 88% for blood and 53% for biopsy, and 27% preferred existing tumor samples to be used in lieu of additional sampling. Caucasians and those with the highest incomes were more agreeable to providing blood and/or biopsy samples, whereas non-Caucasians and low-income earners preferred utilization of existing tumor samples over additional blood sampling (p<0.05). Conclusions: Patients were more willing to provide a new blood sample than a biopsy sample for PGT. Despite the vast majority agreeing to the potential benefit of additional sampling, only half were willing to provide a new biopsy sample. Level of willingness was related to sociocultural and economic factors. Improved patient education and increased efforts to design blood-based markers may improve uptake of PGT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,070

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,132
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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