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Enregistrement W2599213460 · doi:10.1183/23120541.00056-2016

Lung function and disease severity in cystic fibrosis patients heterozygous for<i>p.Arg117His</i>

2017· article· en· W2599213460 sur OpenAlexfundno aff
Michal Shteinberg, D.G. Downey, D. Beattie, John McCaughan, Alastair Reid, Nili Stein, J.S. Elborn

Notice bibliographique

RevueERJ Open Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesQueen's University BelfastQueen's UniversityVertex PharmaceuticalsGilead Sciences
Mots-clésCystic fibrosisMedicineInternal medicineGastroenterologyCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorLungSputumPathologyTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression ofp.Arg117Hiscystic fibrosis (CF) transmembrane conductance regulator is influenced by a polythymidine (poly-T) tract and a thymidine–guanine (TG) repeat on intron 9, which vary in length and affect exon 10 skipping. We compared clinical characteristics and the rate of progression of lung disease of CF patients carrying thep.Arg117Hismutation with different intron 9 varying sequences (poly-T) and mutation classesin trans. Data were collected from patients in Northern Ireland, UK, including diagnostic features, sweat chloride, nutritional status, sputum microbiology, CF-related complications and lung function. Poly-T and TG repeats were determined by PCR. Forced expiratory volume in 1 s (FEV1) decline was determined from linear regression of FEV1measurements of patients over time. We identified 62 patients withp.Arg117His, 55 with a class I/II mutationin transand six withp.Arg117His/p.Gly551Asp. 42 patients had 5T and 13 had 7T. All patients had 12 TG repeats. Patients withp.Arg117His-5T had greater lung function decline, sweat chloride concentrations, pancreatic insufficiency and prevalence ofPseudomonas aeruginosainfection compared with patients withp.Arg117His-7T. Lung function decline and disease severity inp.Arg117Hisis determined by the poly-T tract length and identity of the mutationin trans.Patients withp.Arg117His-5T and a second class I/II mutation have a severity similar top.Phe508delhomozygous patients, although lung function decline is delayed to an older age. There may be linkage disequilibrium betweenp.Arg117Hisand 12 TG repeats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,361 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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