Association of Tissue Promoter Methylation Levels of APC, RASSF1A, CYP26A1, and TBX15 with Prostate Cancer Progression
Notice bibliographique
Résumé
Aberrant promoter methylation is known to silence tumor-suppressor genes in prostate cancer. Using a quantitative real-time PCR assay(MethyLight), I determined promoter methylation levels of APC, RASSF1A, CYP26A1 and TBX15 in 219 radical prostatectomies diagnosed between 1998-2001, examined their correlation with clinicopathological follow-up data including Gleason Pattern(GP), Gleason Score(GS) and pathological stage, and explored their potential in predicting biochemical recurrence(BR) using univariate and multivariate analyses. I demonstrated that methylation status of all four genes could accurately differentiate normal from cancerous tissues. Quantitative methylation levels of APC and TBX15 correlated strongly with GP, GS, and pathological stage. Both APC and TBX15 methylation levels could significantly predict BR in univariate analysis(p-value=0.028 and 0.003, respectively). The methylation profiles of APC and TBX15 combined could discriminate patients into high, intermediate, and low risk groups of BR(p-value=0.005). My project demonstrated that quantitative increase in promoter methylation levels of APC and TBX15 were associated with PCa progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».