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Enregistrement W2600395519 · doi:10.1038/srep44585

The evolutionary and phylogeographic history of woolly mammoths: a comprehensive mitogenomic analysis

2017· article· en· W2600395519 sur OpenAlexafffund
Dan Chang, Michael Knapp, Jacob Enk, Sebastian Lippold, Martin Kircher, Adrian M. Lister, R. D. E. MacPhee, Chris Widga, Paul Czechowski, Robert S. Sommer, Emily Hodges, Nikolaus Stümpel, Ian Barnes, Love Dalén, А. П. Деревянко, Mietje Germonpré, Alexandra Hillebrand‐Voiculescu, Silviu Constantin, Т. В. Кузнецова, Dick Mol, Thomas Rathgeber, Wilfried Rosendahl, Alexei Tikhonov, Eske Willerslev, Greg Hannon, Carles Lalueza‐Fox, Ulrich Joger, Hendrik N. Poinar, Michael Hofreiter, Beth Shapiro

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLundbeckfondenCanada Research ChairsSight Research UKNatural Environment Research CouncilGordon and Betty Moore FoundationMax-Planck-GesellschaftDeutsche ForschungsgemeinschaftDavid and Lucile Packard Foundation
Mots-clésMammothBeringiaPhylogeographyPleistoceneBiologyRange (aeronautics)Evolutionary biologyHolarcticPopulationDemographic historyPhylogeneticsZoologyPaleontologyGenetic variationGeneticsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Near the end of the Pleistocene epoch, populations of the woolly mammoth (Mammuthus primigenius) were distributed across parts of three continents, from western Europe and northern Asia through Beringia to the Atlantic seaboard of North America. Nonetheless, questions about the connectivity and temporal continuity of mammoth populations and species remain unanswered. We use a combination of targeted enrichment and high-throughput sequencing to assemble and interpret a data set of 143 mammoth mitochondrial genomes, sampled from fossils recovered from across their Holarctic range. Our dataset includes 54 previously unpublished mitochondrial genomes and significantly increases the coverage of the Eurasian range of the species. The resulting global phylogeny confirms that the Late Pleistocene mammoth population comprised three distinct mitochondrial lineages that began to diverge ~1.0-2.0 million years ago (Ma). We also find that mammoth mitochondrial lineages were strongly geographically partitioned throughout the Pleistocene. In combination, our genetic results and the pattern of morphological variation in time and space suggest that male-mediated gene flow, rather than large-scale dispersals, was important in the Pleistocene evolutionary history of mammoths.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,471
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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