The <i>Arabidopsis</i> paraquat resistant1 mutant accumulates leucine upon dark treatment
Notice bibliographique
Résumé
The Arabidopsis paraquat resistant1 (PAR1) was classified as L-type amino acid transporter 4 (LAT4) based on a phylogenetic analysis of selected genes from Saccharomyces cerevisiae, Arabidopsis thaliana (L.) Heynh, and Homo sapiens that clustered LAT4 with four other members as a LAT family in Arabidopsis. In silico analysis of the Arabidopsis LATs identified an amino acid permease domain and motifs that are common in amino acid transporters. However, their role in amino acid transport remained to be studied. A knockout mutant for PAR1/LAT4 gene, reported here as par1-5, showed significantly altered growth compared with wild type on leucine-containing growth medium. Mutant par1-5 seedlings showed reduced biomass compared with wild type on nitrate-containing Murashige and Skoog growth medium, which was further reduced when grown on medium containing nitrate and leucine. Radio-labelled leucine uptake studies using leaf protoplasts and seedlings showed increased accumulation of leucine in par1-5 mutants compared with wild type. Increased accumulation of leucine in par1-5 was detected when seedlings or protoplasts were treated in the dark prior to isotopic feeding. These studies suggest that the PAR1/LAT4 protein, in addition to its ability to mediate paraquat and polyamine transport, possess leucine transport activity that is regulated by physiological conditions such as dark induction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».