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Enregistrement W2600832835 · doi:10.1080/07060661.2017.1313782

Classification of imazalil resistance in an international collection of <i>Penicillium digitatum</i> isolates

2017· article· en· W2600832835 sur OpenAlexvenueno aff
Mareli Kellerman, A. McLeod, Ilze Beukes, Lindy Joy Rose, Arno Erasmus, Paul H. Fourie

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFungal Plant Pathogen Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPenicillium digitatumFungicideEC50BiologyMultiplex polymerase chain reactionHorticultureVeterinary medicineGenotypeBotanyPolymerase chain reactionGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A total of 213 Penicillium digitatum isolates with resistance to the fungicide imazalil (IMZ) originating from green moulded citrus fruit from several countries (South Africa, USA, Uruguay, Spain, Israel, Cyprus, Chile, Australia and Argentina) were tested for their Cyp51 IMZ-resistance group (R1 to R3) using a published multiplex PCR assay. As well, the level of resistance (measured as EC50 values) was determined. Isolates from the USA showed the highest resistance group diversity (isolates belonged to R1, R2 and R3 groups) and lowest EC50 values. The isolates from the other countries were all classified into the R3 group, except for Chile, which also contained R1 isolates. There was no correlation between the level of resistance of isolates and the resistance group genotype. In general, IMZ resistance was most commonly associated (88.3%) with the R3 group. This study is the first to investigate the distribution of IMZ resistance genotypes in P. digitatum populations from a broad international scale.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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