External quality assurance of breast cancer pathologic reporting in Kenya
Notice bibliographique
Résumé
e11586 Background: Eighty percent of women diagnosed with breast cancer (BC) in East Africa present with advanced disease; current literature suggests a preponderance of triple negative/basal like breast cancer in this subset of African women. These studies are limited by their retrospective nature, small numbers, and unclear quality of pathologic specimen reporting. The objective of this study is to provide external quality assurance (EQA), quality control, and validation of hormone receptor and Her2 status of breast cancer specimens from Kenya. Methods: 108 retrospectively identified BC tumour blocks from the Aga Khan University Hospital (Nairobi, Kenya) during 2006–2008 will undergo repeat pathologic assessment for estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), and Her2 status at Sunnybrook Health Sciences Center (Toronto, Canada).Currently at the Aga Khan University Pathology Lab, ER,PR and Her2 testing is performed manually once every two weeks using Heat Induced Antigen Retrieval and Dako reagents including the ENVISION detection system. Parallel controls of known tissue reactivity are also run; however there is currently no formal EQA. Results: Results will be used to identify areas of improvement in specimen handling and pathology reporting. Conclusions: Standardized and accurate pathologic assessment of BC specimens in East Africa is essential for establishing centres of excellence in Kenya and the wider East African region for hormone receptor and Her2 neu analysis. Results would contribute to understanding the prevalence of triple negative disease in East Africa, lead to improved treatment recommendations and patient outcomes, and serve as a foundation for prospective studies in East Africa. No significant financial relationships to disclose.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,083 | 0,095 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».