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Enregistrement W2601265751 · doi:10.1093/cid/cix249

Decreased Azithromycin Susceptibility of<i>Neisseria gonorrhoeae</i>Isolates in Patients Recently Treated with Azithromycin

2017· article· en· W2601265751 sur OpenAlexaff
Carolien M. Wind, Esther de Vries, Maarten F. Schim van der Loeff, Martijn S. van Rooijen, Alje P. van Dam, Walter Demczuk, Irene Martín, Henry J.C. de Vries

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAzithromycinNeisseria gonorrhoeaeMTRRMedicineMinimum inhibitory concentrationMicrobiologyGonorrheaMultilocus sequence typingInternal medicineErythromycinGenotypeBiologyAntibioticsImmunologyGeneticsGeneHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Increasing azithromycin usage and resistance in Neisseria gonorrhoeae threatens current dual treatment. Because antimicrobial exposure influences resistance, we analyzed the association between azithromycin exposure and decreased susceptibility of N. gonorrhoeae. Methods: We included N. gonorrhoeae isolates of patients who visited the Amsterdam STI Clinic between 1999 and 2013 (t0), with another clinic visit in the previous 60 days (t-1). Exposure was defined as the prescription of azithromycin at t-1. Using multivariable linear regression, we assessed the association between exposure and azithromycin minimum inhibitory concentration (MIC). Whole genome sequencing (WGS) was performed to produce a phylogeny and identify multilocus sequence types (MLST), N. gonorrhoeae multiantigen sequence types (NG-MAST), and molecular markers of azithromycin resistance. Results: We included 323 isolates; 212 were unexposed to azithromycin, 14 were exposed ≤30 days, and 97 were exposed between 31 and 60 days before isolation. Mean azithromycin MIC was 0.28 mg/L (range, <0.016-24 mg/L). Linear regression adjusted for age, ethnicity, infection site, and calendar year showed a significant association between azithromycin exposure ≤30 days and MIC (β, 1.00; 95% confidence interval, 0.44-1.56; P = .002). WGS was performed on 31 isolates: 14 unexposed, 14 exposed to azithromycin ≤30 days before isolation, and 3 t-1 isolates. Exposure to azithromycin was significantly associated with A39T or G45D mtrR mutations (P = .046) but not with MLST or NG-MAST types. Conclusions: The results suggest that frequent azithromycin use in populations at high risk of contracting N. gonorrhoeae induces an increase in MIC and may result in resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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