Evaluation of spontaneous generation of allelic variation in soybean in response to sexual hybridization and stress
Notice bibliographique
Résumé
Espinosa, K., Boelter, J., Lolle, S., Hopkins, M., Goggi, S., Palmer, R. G. and Sandhu, D. 2015. Evaluation of spontaneous generation of allelic variation in soybean in response to sexual hybridization and stress. Can. J. Plant Sci. 95: 405–415. Intra-cultivar variation reported in pure lines of soybean has been hypothesized to result from genetic mechanisms contributing to de novo genetic variation. In this study we have detected allele switching by following segregation patterns of Aconitase-4 isozyme in sexual crosses and pure lines. In sexual crosses, one F 2 plant showed a switch at the Aconitase-4 (Aco4) locus from the expected heterozygous genotype Aco4-ac to Aco4-ab. In the pure lines grown in a honeycomb planting design and treated with an accelerated aging test, multiple cases of allele switching were detected at the Aco4 locus. Both single and double switches were detected that were stable and heritable. These findings indicate that the generation of endogenous variation continues in pure lines as a result of intrinsic genetic mechanisms. With a long-term goal of understanding the genetic nature of the changes, we genetically mapped the Aco4 gene to a 3.3 cM region on Chromosome 11. The corresponding physical region is ∼293 kb with 39 predicted genes. Of these, Glyma.11g080600 is of particular interest, as it shows 93% and 88% identity to Medicago truncatula and Arabidopsis aconitase genes, respectively. Further characterization of the soybean Aco4 gene may shed light on genetic mechanisms responsible for allele switching.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».