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Enregistrement W2601346497 · doi:10.1093/ofid/ofx050

Infections in Hematopoietic Cell Transplant Recipients: Results From the Organ Transplant Infection Project, a Multicenter, Prospective, Cohort Study

2017· article· en· W2601346497 sur OpenAlexaff
Mindy G. Schuster, Angela A. Cleveland, Erik R. Dubberke, Carol A. Kauffman, Robin K. Avery, Shahid Husain, David L. Paterson, Fernanda P. Silveira, Tom Chiller, Kaitlin Benedict, Kathleen M. Murphy, Peter G. Pappas

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeutropenia and Cancer Infections
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionUniversity of Michigan
Mots-clésMedicineHematopoietic cellProspective cohort studyCohortCohort studyHematopoietic stem cell transplantationInternal medicineOrgan transplantationPathogenic organismIntensive care medicineBone marrow transplantTransplantationImmunologyHaematopoiesisStem cellBone marrow transplantationMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Infection is a major cause of morbidity and mortality after allogeneic hematopoietic cell transplantation (HCT). Our object was to better define the epidemiology and outcomes of infections after HCT. Methods This was a prospective, multicenter cohort study of HCT recipients and conducted from 2006 to 2011. The study included 4 US transplant centers and 444 HCT recipients. Data were prospectively collected for up to 30 months after HCT using a standardized data collection tool. Results The median age was 53 years, and median follow up was 413 (range, 5–980) days. The most common reason for HCT was hematologic malignancy (87%). The overall crude mortality was 52%. Death was due to underlying disease in 44% cases and infection in 21%. Bacteremia occurred in 231 (52%) cases and occurred early posttransplant (median day 48). Gram-negative bloodstream infections were less frequent than Gram-positive, but it was associated with higher mortality (45% vs 13%, P = .02). Clostridium difficile infection developed in 148 patients (33%) at a median of 27 days post-HCT. There were 53 invasive fungal infections (IFIs) among 48 patients (11%). The median time to IFI was 142 days. Of 155 patients with cytomegalovirus (CMV) infection, 4% had CMV organ involvement. Varicella zoster infection (VZV) occurred in 13 (4%) cases and was disseminated in 2. Infection with respiratory viruses was seen in 49 patients. Pneumocystis jirovecii pneumonia was rare (1%), and there were no documented cases of nocardiosis, toxoplasmosis, endemic mycoses, or mycobacterial infection. This study lacked standardized antifungal and antiviral prophylactic strategies. Conclusions Infection remains a significant cause of morbidity and mortality after HCT. Bacteremias and C difficile infection are frequent, particularly in the early posttransplant period. The rate of IFI is approximately 10%. Organ involvement with CMV is infrequent, as are serious infections with VZV and herpes simplex virus, likely reflecting improved prevention strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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