Phenotypic Classification of Paediatric Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
This thesis explores aspects pertinent to the phenotypic classification of paediatric patients with inflammatory bowel disease (IBD). In the current era it has never been more important to have rigourous phenotypic classification to facilitate genotype-phenotype correlation studies as well as to optimize design of clinical trials of emerging therapies, where frequently response may differ according to phenotype of disease.\nThe first study examined the reliability of the Montreal Classification for classifying paediatric IBD patients. This is the first study exploring the reliability of phenotypic classification in a paediatric population. The reliability of assigning an overall diagnosis of type of IBD was good, but not excellent. Amongst Crohn’s disease patients, reliability of assigning disease behaviour was excellent, while the reliability of assigning disease location categories varied from fair to good. The percentage agreement when describing disease extent for ulcerative colitis was high. \nThe second study described the evolution of disease phenotype in a cohort of paediatric IBD patients. Similar to observations in adult-onset IBD, disease location was found to be relatively stable, while Crohn’s disease behaviour evolves from an inflammatory to a stricturing and/or penetrating phenotype in 20% of patients by 5 years of follow-up.\nThe final study explored the association between 2 polymorphisms in the NOD2 gene with the requirement for intestinal resection (a surrogate marker of complicated disease) in models that included and excluded disease duration. Although no difference was found, this may have been influenced by data quality, which was suboptimal. \nIn conclusion, this thesis has demonstrated that imprecision exists in the phenotyping of paediatric IBD patients, in whom phenotypic characteristics evolve over time. It is pertinent that disease duration be considered in any study attempting to make phenotypic correlations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».