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Enregistrement W2602876382 · doi:10.3389/fmicb.2017.00377

Small Luggage for a Long Journey: Transfer of Vesicle-Enclosed Small RNA in Interspecies Communication

2017· review· en· W2602876382 sur OpenAlexafffund
Fabio Alexis Lefebvre, Éric Lécuyer

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Clinical Research InstituteUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésRNABiologySmall RNACrosstalkCell biologyRNA interferenceArgonauteSmall interfering RNARNA silencingExtracellular vesicleComputational biologyMicrovesiclesGeneticsGenemicroRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the evolutionary arms race, symbionts have evolved means to modulate each other's physiology, oftentimes through the dissemination of biological signals. Beyond small molecules and proteins, recent evidence shows that small RNA molecules are transferred between organisms and transmit functional RNA interference signals across biological species. However, the mechanisms through which specific RNAs involved in cross-species communication are sorted for secretion and protected from degradation in the environment remain largely enigmatic. Over the last decade, extracellular vesicles have emerged as prominent vehicles of biological signals. They can stabilize specific RNA transcripts in biological fluids and selectively deliver them to recipient cells. Here, we review examples of small RNA transfers between plants and bacterial, fungal, and animal symbionts. We also discuss the transmission of RNA interference signals from intestinal cells to populations of the gut microbiota, along with its roles in intestinal homeostasis. We suggest that extracellular vesicles may contribute to inter-species crosstalk mediated by small RNA. We review the mechanisms of RNA sorting to extracellular vesicles and evaluate their relevance in cross-species communication by discussing conservation, stability, stoichiometry, and co-occurrence of vesicles with alternative communication vehicles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,976
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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