Inheritance and development of EST-SSR marker associated with turnip mosaic virus resistance in Chinese cabbage
Notice bibliographique
Résumé
Li, Q., Tong, H., Zhang, Z., Zhao, Z. and Song, X. 2011. Inheritance and development of EST-SSR marker associated with turnip mosaic virus resistance in Chinese cabbage. Can. J. Plant Sci. 91: 707–715. Turnip mosaic virus (TuMV) is one of the major pathogens infecting Brassica crops (including Chinese cabbage), and often causes serious reductions in yield and quality. Breeding for resistant cultivars is complicated by the existence of numerous TuMV strains and isolates. The objective of this research was to determine the mode of inheritance and to develop molecular markers associated with TuMV resistance in Chinese cabbage. F1and F2populations were developed from the cross between 71-36-2 (susceptible) and 73 (resistant) lines and mechanically inoculated with TuMV-C4. Inheritance analysis by visual scoring and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) indicated that resistance to TuMV-C4 in this cross was controlled by one recessive gene. A total of 132 EST-SSR primers were designed from EST sequences available in public databases. Seven primers detected polymorphism between parental genotypes. Marker HCC259 was associated with the TuMV resistance Ph-retr02. The distance between the marker and the TuMV resistance gene retr02 was 3.8 cM. This is the first co-dominant marker linked to the TuMV resistance gene with a distance less than 5.0 cM in Chinese cabbage. This marker was suitable for TuMV-C4 resistance screening in progenies from the cross between lines 73 (resistant) and susceptible line, 71-36-2. The usefulness of this marker was validated in 21 additional resistant and susceptible lines. This marker has the potential to simplify and accelerate breeding Chinese cabbage cultivars resistant to TuMV-C4.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».