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Enregistrement W2603144992 · doi:10.4141/cjps10123

Inheritance and development of EST-SSR marker associated with turnip mosaic virus resistance in Chinese cabbage

2011· article· en· W2603144992 sur OpenAlexvenueno aff
Qiao‐Yun Li, Tong HaiShen, Zhigang Zhang, Xiyun Song

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYoung Scientists Fund
Mots-clésTurnip mosaic virusBiologyBrassicaGeneticsGeneCultivarGenotypeGenetic markerMarker-assisted selectionPotyvirusVirusPlant virusVirologyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Li, Q., Tong, H., Zhang, Z., Zhao, Z. and Song, X. 2011. Inheritance and development of EST-SSR marker associated with turnip mosaic virus resistance in Chinese cabbage. Can. J. Plant Sci. 91: 707–715. Turnip mosaic virus (TuMV) is one of the major pathogens infecting Brassica crops (including Chinese cabbage), and often causes serious reductions in yield and quality. Breeding for resistant cultivars is complicated by the existence of numerous TuMV strains and isolates. The objective of this research was to determine the mode of inheritance and to develop molecular markers associated with TuMV resistance in Chinese cabbage. F1and F2populations were developed from the cross between 71-36-2 (susceptible) and 73 (resistant) lines and mechanically inoculated with TuMV-C4. Inheritance analysis by visual scoring and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) indicated that resistance to TuMV-C4 in this cross was controlled by one recessive gene. A total of 132 EST-SSR primers were designed from EST sequences available in public databases. Seven primers detected polymorphism between parental genotypes. Marker HCC259 was associated with the TuMV resistance Ph-retr02. The distance between the marker and the TuMV resistance gene retr02 was 3.8 cM. This is the first co-dominant marker linked to the TuMV resistance gene with a distance less than 5.0 cM in Chinese cabbage. This marker was suitable for TuMV-C4 resistance screening in progenies from the cross between lines 73 (resistant) and susceptible line, 71-36-2. The usefulness of this marker was validated in 21 additional resistant and susceptible lines. This marker has the potential to simplify and accelerate breeding Chinese cabbage cultivars resistant to TuMV-C4.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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