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Enregistrement W2603302306 · doi:10.4039/tce.2017.5

Development of a multiplex polymerase chain reaction assay for the identification of common cutworm species (Lepidoptera: Noctuidae) infesting canola in western Canada

2017· article· en· W2603302306 sur OpenAlexafffundabout
Martin A. Erlandson, Jennifer Holowachuk, Edyta Sieminska, Jeremy D. Hummel, Jennifer Otani, Kevin D. Floate

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect Pheromone Research and Control
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesCanola Council of Canada
Mots-clésCutwormBiologyNoctuidaeCanolaPEST analysisLepidoptera genitaliaBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cutworms (Lepidoptera: Noctuidae) constitute an important insect pest complex that causes damage to a variety of crops across western Canada and particularly in canola ( Brassica napus Linnaeus; Brassicaceae) crops in recent years. However, individual cutworms are very difficult to identify to species based on morphology alone, particularly at the larval stage. Problems with pest identification can lead to difficulties in recommending appropriate management strategies for specific cutworm infestations. In the current study we have developed and applied a single-step multiplex polymerase chain reaction assay, based on the rRNA ITS2 genomic sequence, which can be used to identify, to the species level, individuals of the following five key cutworm species: Agrotis orthogonia Morrison, Euxoa auxiliaris (Grote), Euxoa ochrogaster (Guenée), Feltia jaculifera (Guenée), and Lacinipolia renigera (Stephens). This molecular identification tool will be a valuable asset in agronomic and ecological studies of cutworm infestations in the canola cropping system across western Canada and potentially could be used as a timely identification tool for determining pest infestations to the species level during outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,736
Score d'incertitude au seuil0,592

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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