Development of a multiplex polymerase chain reaction assay for the identification of common cutworm species (Lepidoptera: Noctuidae) infesting canola in western Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cutworms (Lepidoptera: Noctuidae) constitute an important insect pest complex that causes damage to a variety of crops across western Canada and particularly in canola (Brassica napusLinnaeus; Brassicaceae) crops in recent years. However, individual cutworms are very difficult to identify to species based on morphology alone, particularly at the larval stage. Problems with pest identification can lead to difficulties in recommending appropriate management strategies for specific cutworm infestations. In the current study we have developed and applied a single-step multiplex polymerase chain reaction assay, based on the rRNA ITS2 genomic sequence, which can be used to identify, to the species level, individuals of the following five key cutworm species:Agrotis orthogoniaMorrison,Euxoa auxiliaris(Grote),Euxoa ochrogaster(Guenée),Feltia jaculifera(Guenée), andLacinipolia renigera(Stephens). This molecular identification tool will be a valuable asset in agronomic and ecological studies of cutworm infestations in the canola cropping system across western Canada and potentially could be used as a timely identification tool for determining pest infestations to the species level during outbreaks.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».