MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2603494809 · doi:10.1534/genetics.117.200592

F-Box Protein XREP-4 Is a New Regulator of the Oxidative Stress Response in <i>Caenorhabditis elegans</i>

2017· article· en· W2603494809 sur OpenAlexfundno aff
Cheng‐Wei Wu, Ying Wang, Keith Choe

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of MinnesotaNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésBiologyCaenorhabditis elegansUbiquitin ligaseTranscription factorCell biologyRepressorProteostasisGeneticsGene knockdownGeneMutantMolecular biologyUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The transcription factor SKN-1 (Skinhead family member-1) in Caenorhabditis elegans is a homolog of the mammalian Nrf-2 protein and functions to promote oxidative stress resistance and longevity. SKN-1 mediates protection from reactive oxygen species (ROS) via the transcriptional activation of genes involved in antioxidant defense and phase II detoxification. Although many core regulators of SKN-1 have been identified, much remains unknown about this complex signaling pathway. We carried out an ethyl methanesulfonate (EMS) mutagenesis screen and isolated six independent mutants with attenuated SKN-1-dependent gene activation in response to acrylamide. All six were found to contain mutations in F46F11.6/xrep-4 (xenobiotics response pathways-4), which encodes an uncharacterized F-box protein. Loss of xrep-4 inhibits the skn-1-dependent expression of detoxification genes in response to prooxidants and decreases survival of oxidative stress, but does not shorten life span under standard culture conditions. XREP-4 interacts with the ubiquitin ligase component SKR-1 and the SKN-1 principal repressor WDR-23, and knockdown of xrep-4 increases nuclear localization of a WDR-23::GFP fusion protein. Furthermore, a missense mutation in the conserved XREP-4 F-box domain that reduces interaction with SKR-1 but not WDR-23 strongly attenuates SKN-1-dependent gene activation. These results are consistent with XREP-4 influencing the SKN-1 stress response by functioning as a bridge between WDR-23 and the ubiquitin ligase component SKR-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,807

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGeneticsMême sujetGenetics, Aging, and Longevity in Model OrganismsTravaux en français237 207