MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2603793890 · doi:10.3389/fimmu.2017.00355

Increased Autophagy-Related 5 Gene Expression Is Associated with Collagen Expression in the Airways of Refractory Asthmatics

2017· article· en· W2603793890 sur OpenAlexafffund
Audrey H. Poon, David F. Choy, Fazila Chouiali, Rakhee K. Ramakrishnan, Bassam Mahboub, Séverine Audusseau, Andrea Mogas, Jeffrey M. Harris, Joseph R. Arron, Catherine Laprise, Qutayba Hamid

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversité du Québec à ChicoutimiMcGill UniversityChristie (Canada)
Organismes subventionnairesGenentechCanada Research Chairs
Mots-clésATG5AsthmaAutophagyPathogenesisMedicineFibrosisPulmonary fibrosisType I collagenAlpha (finance)Gene expressionImmunologyPathologyGeneBiologyApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Fibrosis, particularly excessive collagen deposition, presents a challenge for treating asthmatic individuals. At present, no drugs can remove or reduce excessive collagen in asthmatic airways. Hence, the identification of pathways involved in collagen deposition would help to generate therapeutic targets to interfere with the airway remodelling process. Autophagy, a cellular degradation process, has been shown to be dysregulated in various fibrotic diseases and genetic association studies in independent human populations have identified autophagy related 5 (ATG5) to be associated with asthma pathogenesis. Hence, the dysregulation of autophagy may contribute to fibrosis in asthmatic airways. Objective This study aimed to determine if (1) collagen deposition in asthmatic airways is associated with ATG5 expression and (2) ATG5 protein expression is associated with asthma per se and severity. Methods Gene expression of transforming growth factor beta 1 (TGFB1), various asthma-related collagen types (collagen, type I, alpha 1 (COL1A1); type II, alpha 1 (COL2A1); type III, alpha 1 (COL3A1); type V, alpha 1 (COL5A1), and type V, alpha 2 (COL5A2)), and ATG5 were measured using mRNA isolated from bronchial biopsies of refractory asthmatic subjects and assessed for pairwise associations. Protein expression of ATG5 in the airways was measured and associations were assessed for asthma per se, severity, and lung function. Main Results In refractory asthmatic individuals, gene expression of ATG5 was positively associated with COL5A1 in the airways. No association was detected between ATG5 protein expression and asthma per se, severity, and lung function. Conclusion & Clinical Relevance Positive correlation between the gene expression patterns of ATG5 and COL5A1 suggests that dysregulated autophagy may contribute to sub-epithelial fibrosis in the airways of refractory asthmatic individuals. This finding highlights the therapeutic potential of ATG5 in ameliorating airway remodelling in the difficult-to-treat refractory asthmatic individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil0,548

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in ImmunologyMême sujetAutophagy in Disease and TherapyTravaux en français237 207