Gene expression changes during acquired resistance to tamoxifen; a preclinical model of post-menopausal breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
3147 Background: Most metastatic breast cancers initially respond to hormonal treatment but all become resistant to these treatments over time. The genetic events that occur during acquired resistance are unknown. To examine the gene expression changes during acquired hormonal resistance, we used a model that mimics ER positive breast cancers in the post-menopausal setting with the tumors responsive to both Tamoxifen (TAM) and aromatase inhibitors. Tumors were analyzed with high density cDNA microarrays to identify genes associated with TAM resistance. Methods: Aromatase-transfected MCF-7Ca human breast cancer cells were grown as tumor xenografts in female ovariectomized athymic nude mice in which an androstenedione supplement was converted to estrogen to stimulate tumor growth. When tumor volume was approximately 300 mm3, the animals were grouped (4 groups, each with n=20) for continued supplementation with androstenedione (Δ4A) only (control), Letrozole (an aromatase inhibitor) 10 μg/day + Δ4A, TAM 100 μg/day + Δ4A, or vehicle. Tumors were then retrieved at various time points during the development of hormone resistance. Tumor RNA samples were compared to reference RNA from Stratagene and incubated with 14K microarrays (Array-Ready Oligo Set, Qiagen). Expression results were analyzed with Genespring 6.1 (Silicon Genetics). Results: We have identified 15 TAM-resistant associated genes that are over-expressed by at least 2-fold, after controlling for genes associated with house-keeping function (vehicle and short term control), proliferation (freely growing tumors without TAM), and TAM inducible genes. They include; cystatin A, TGFbeta1-induced anti-apoptotic factor, cadherin1 E-cadherin, Snf2-related CBP activator protein, and chromatin-remodelling genes. At the meeting we will also present data on the expression changes seen in the Her-regulin family, cyclin family and MAP kinase genes during acquired TAM resistance. Patient biopsies are currently being collected and analyzed to validate these observations. Conclusions: Chromatin remodeling genes are over-expressed in acquired TAM-resistance. Author Disclosure Employment or Leadership Consultant or Advisory Stock Ownership Honoraria Research Funding Expert Testimony Other Remuneration Novartis Novartis
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».