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Enregistrement W2604335396 · doi:10.3389/fendo.2017.00061

Distinct Conformational Dynamics of Three G Protein-Coupled Receptors Measured Using FlAsH-BRET Biosensors

2017· article· en· W2604335396 sur OpenAlexafffund
Kyla Bourque, Darlaine Pétrin, Rory Sleno, Dominic Devost, Alice Zhang, Terence E. Hébert

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Endocrinology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchQuébec Consortium for Drug DiscoveryMcGill University
Mots-clésG protein-coupled receptorReceptorIntracellularAgonistBiophysicsChemistryCell biologyFörster resonance energy transferProstaglandin E2 receptorBiosensorBiochemistryBiologyFluorescencePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A number of studies have profiled GPCR conformation using fluorescent biaresenical hairpin binders (FlAsH) as acceptors for BRET or FRET. These conformation-sensitive biosensors allow reporting of movements occurring on the intracellular surface of a receptor to investigate mechanisms of receptor activation and function. Here, we generated eight FlAsH BRET-based biosensors within the sequence of the β2-adrenergic receptor (β2AR) and compared agonist-induced responses to the angiotensin II receptor type I (AT1R) and the prostaglandin F2α receptor (FP). Although all three receptors had FlAsH binding sequences engineered into the third intracellular loops and carboxyl-terminal domain, both the magnitude and kinetics of the BRET responses to ligand were receptor-specific. Biosensors in ICL3 of both the AT1R and FP responded robustly when stimulated with their respective full agonists as opposed to the β2AR where responses in the third intracellular loop were weak and transient when engaged by isoproterenol. C-tail sensors responses were more robust in the β2AR and AT1R but not in FP. Even though GPCRs share the heptahelical topology and are expressed in the same cellular background, different receptors have unique conformational fingerprints.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,765

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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