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Enregistrement W2604856012 · doi:10.1016/j.jcmgh.2017.03.011

The Circadian Clock Gene BMAL1 Coordinates Intestinal Regeneration

2017· article· en· W2604856012 sur OpenAlexafffund
Kyle Stokes, Abrial Ann Marie Cooke, Hanna Chang, David R. Weaver, David T. Breault, Phillip Karpowicz

Notice bibliographique

RevueCellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentRIKENHarvard Digestive Diseases Center, Harvard UniversityNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of Windsor
Mots-clésCircadian rhythmCircadian clockBiologyIntestinal epitheliumCLOCKGastrointestinal functionSmall intestineCell biologyEndocrinologyInternal medicineShort bowel syndromeEpitheliumMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We investigated the circadian timing of intestinal regeneration using the null mutant BMAL1.Our results show that the circadian clock regulates the timing of inflammation and proliferation during regeneration. BACKGROUND & AIMS:The gastrointestinal syndrome is an illness of the intestine caused by high levels of radiation.It is characterized by extensive loss of epithelial tissue integrity, which initiates a regenerative response by intestinal stem and precursor cells.The intestine has 24-hour rhythms in many physiological functions that are believed to be outputs of the circadian clock: a molecular system that produces 24-hour rhythms in transcription/ translation.Certain gastrointestinal illnesses are worsened when the circadian rhythms are disrupted, but the role of the circadian clock in gastrointestinal regeneration has not been studied. METHODS:We tested the timing of regeneration in the mouse intestine during the gastrointestinal syndrome.The role of the circadian clock was tested genetically using the BMAL1 loss of function mouse mutant in vivo, and in vitro using intestinal organoid culture. RESULTS:The proliferation of the intestinal epithelium follows a 24-hour rhythm during the gastrointestinal syndrome.The circadian clock runs in the intestinal epithelium during this pathologic state, and the loss of the core clock gene, BMAL1, disrupts both the circadian clock and rhythmic proliferation.Circadian activity in the intestine involves a rhythmic production of inflammatory cytokines and subsequent rhythmic activation of the JNK stress response pathway.CONCLUSIONS: Our results show that a circadian rhythm in inflammation and regeneration occurs during the gastrointestinal syndrome.The study and treatment of radiation-induced illnesses, and other gastrointestinal illnesses, should consider 24-hour timing in physiology and pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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