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Enregistrement W2605068580 · doi:10.3389/fpls.2017.00528

Dissecting Low Atmospheric Pressure Stress: Transcriptome Responses to the Components of Hypobaria in Arabidopsis

2017· article· en· W2605068580 sur OpenAlexafffund
Mingqi Zhou, Jordan Callaham, Matthew Reyes, Michael Stasiak, Alberto Riva, Agata K. Żupańska, Mike Dixon, Anna‐Lisa Paul, Robert J. Ferl

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant responses to water stress
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesInternational Centre for Bamboo and RattanKennedy Space CenterUniversity of GuelphNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésTranscriptomeArabidopsisAtmospheric pressureArabidopsis thalianaStress (linguistics)Freezing toleranceBiologyChemistryGeneGene expressionGeneticsPhysicsMeteorologyMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Controlled hypobaria presents biology with an environment that is never encountered in terrestrial ecology, yet the apparent components of hypobaria are stresses typical of terrestrial ecosystems. High altitude, for example, presents terrestrial hypobaria always with hypoxia as a component stress, since the relative partial pressure of O2 is constant in the atmosphere. Laboratory-controlled hypobaria, however, allows the dissection of pressure effects away from the effects typically associated with altitude, in particular hypoxia, as the partial pressure of O2 can be varied. In this study, whole transcriptomes of plants grown in ambient (97 kPa/pO2=21 kPa) atmospheric conditions were compared to those of plants transferred to five different atmospheres of varying pressure and oxygen composition for 24 hours: 50 kPa/pO2=10 kPa, 25 kPa/pO2=5 kPa, 50 kPa/pO2=21 kPa, 25 kPa/pO2=21 kPa, or 97 kPa/pO2=5 kPa. The plants exposed to these environments were 10 day old Arabidopsis seedlings grown vertically on hydrated nutrient plates. In addition, 5 day old plants were also exposed for 24 hrs to the 50 kPa and ambient environments to evaluate age-dependent responses. The gene expression profiles from roots and shoots showed that the hypobaric response contained more complex gene regulation than simple hypoxia, and that adding back oxygen to normoxic conditions did not completely alleviate gene expression changes in hypobaric responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,137
Score d'incertitude au seuil0,405

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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