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Enregistrement W2605095262 · doi:10.1158/1557-3125.dnarepair16-ia14

Abstract IA14: Mechanisms of the ATR-dependent replication stress response

2017· article· en· W2605095262 sur OpenAlexaboutno aff
David Cortez

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReplisomeBiologyDNA replicationReplication (statistics)DNA re-replicationDNA damageProteomeCell biologyGeneticsComputational biologyEukaryotic DNA replicationDNAVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Replication stress can be caused by DNA damage, difficult to replicate DNA sequences, collisions between replication and transcriptional machineries, and aberrations in the replication timing or other regulatory mechanisms. Cancer cells often have elevated levels of replication stress driven by oncogenes. Replication stress response pathways are important in these contexts to allow cells to complete replication, maintain genome stability, and remain viable. Drugs that increase the replication stress burden or inactivate components of the replication stress response pathway can be useful as cancer therapeutics. For example, inhibitors of the replication checkpoint kinase ATR are currently being tested in clinical trials. To better understand how replication stress response pathways operate, we have taken both genetic and proteomic approaches. These approaches include purifying active and stressed replication fork proteomes using isolation of proteins on nascent DNA (iPOND). iPOND can monitor changes in the replication fork proteome and when combined with mass spectrometry provides an unbiased analysis. These approaches have allowed us characterize the consequences of replication stress and functions of ATR. For example, we found that ATR does not regulate the stability of the replisome itself in response to stress, but it does direct the action of a number of fork remodeling enzymes including SMARCAL1 that act to protect and repair damaged forks. In addition, iPOND identified new replication stress response proteins including ETAA1—a new regulator of the ATR checkpoint kinase. I will present our latest data on the replication stress response emphasizing the results from iPOND proteomic analyses. Citation Format: David Cortez. Mechanisms of the ATR-dependent replication stress response [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on DNA Repair: Tumor Development and Therapeutic Response; 2016 Nov 2-5; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2017;15(4_Suppl):Abstract nr IA14.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,466

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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Résumé présentoui

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