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Enregistrement W2605142744 · doi:10.3389/fphar.2017.00195

Development of Automated Patch Clamp Technique to Investigate CFTR Chloride Channel Function

2017· article· en· W2605142744 sur OpenAlexafffund
Arnaud Billet, Lionel Froux, John W. Hanrahan, Frédéric Becq

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Pharmacology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAssociation Vaincre la MucoviscidoseCystic Fibrosis TrustCystic Fibrosis Canada
Mots-clésPatch clampChloride channelCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorClampCystic fibrosisChemistryBiophysicsComputer scienceBiologyMedicineBiochemistryInternal medicineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The chloride channel Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator (CFTR) is defective in Cystic Fibrosis (CF) and mutation of its encoding gene leads to various defects such as retention of the misfolded protein in the endoplasmic reticulum, reduced stability at the plasma membrane, abnormal channel gating with low open probability, and thermal instability which leads to inactivation of the channel at physiological temperature. Pharmacotherapy is one major therapeutic approach in the CF field and needs sensible and fast tools to identify promising compounds. The high throughput screening assays available are often fast and sensible techniques but with lack of specificity. Few works used automated patch clamp for CFTR recording and none have compared conventional and planar techniques and demonstrated their capabilities for different types of experiments. In this study we evaluated the use of planar parallel automated patch clamp technique for pharmacological search of CFTR trafficking correctors and CFTR function modulators. Using optimized conditions, we recorded both wt- and corrected F508del-CFTR chloride currents with automated whole cell patch clamp and compared the data to results obtained with conventional manual whole cell patch clamp. We found no significant difference in patch clamp parameters such as cell capacitance and series resistance between automated and manual patch clamp. Also, the results showed good similarities of CFTR currents recording between the two methods. We showed that similar stimulation protocols could be used in both manual and automatic technics allowing precise control of temperature, classic I/V relationship, monitoring of current stability in time. In conclusion, parallel patch clamp recording allows rapid and efficient investigation of CFTR currents with a variety of tests available and could be considered as new tool for medium throughput screening in CF pharmacotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,628

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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