Occurrence, detection, and quantification of economically important viruses in healthy and unhealthy honey bee (Hymenoptera: Apidae) colonies in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The occurrence, quantification, and distribution patterns of deformed wing virus (DWV) and sacbrood virus (SBV), (family Iflaviridae); black queen cell virus (BQCV), Israeli acute paralysis virus (IAPV), Kashmir bee virus (KBV), and acute bee paralysis virus (ABPV) (family Dicistroviridae), and chronic bee paralysis virus (CBPV) (unclassified), were characterised in 80 “healthy” honey bee ( Apis mellifera Linnaeus; Hymenoptera: Apidae) colonies and 23 “unhealthy” colonies by employing reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for virus identification and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) for quantification. All seven viruses were common but the most prevalent viruses were DWV, followed by BQCV and IAPV. For most viruses, prevalence in surviving but unhealthy colonies in spring did not differ from that of healthy baseline colony levels in fall suggesting spring prevalence level would not be a useful metric for diagnosis of factors contributing to colony loss. Sacbrood virus was the only virus that was more prevalent in unhealthy colonies from Manitoba, Canada than in healthy from colonies across Canada but did not differ from healthy colonies within Manitoba. Multiple infections were ubiquitous with a few colonies having simultaneous infection with as many as five viruses. Among the three viruses quantified by qPCR, DWV had the highest relative concentrations in pooled samples of worker bees. Deformed wing virus was the only virus within healthy colonies that differed in fall concentration among provinces and was at high levels in unhealthy colonies. Black queen cell virus was positively correlated with IAPV across all samples. Our study provides the first major baseline study of viruses in Canadian honey bees.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».