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Enregistrement W2605240093 · doi:10.4039/tce.2015.23

Occurrence, detection, and quantification of economically important viruses in healthy and unhealthy honey bee (Hymenoptera: Apidae) colonies in Canada

2015· article· en· W2605240093 sur OpenAlexaffabout
Suresh D. Desai, Santosh Kumar, R. William Currie

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect and Pesticide Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeformed wing virusBiologyVirusHoney beeVirologyApidaeHymenopteraPolymerase chain reactionZoologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The occurrence, quantification, and distribution patterns of deformed wing virus (DWV) and sacbrood virus (SBV), (family Iflaviridae); black queen cell virus (BQCV), Israeli acute paralysis virus (IAPV), Kashmir bee virus (KBV), and acute bee paralysis virus (ABPV) (family Dicistroviridae), and chronic bee paralysis virus (CBPV) (unclassified), were characterised in 80 “healthy” honey bee ( Apis mellifera Linnaeus; Hymenoptera: Apidae) colonies and 23 “unhealthy” colonies by employing reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for virus identification and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) for quantification. All seven viruses were common but the most prevalent viruses were DWV, followed by BQCV and IAPV. For most viruses, prevalence in surviving but unhealthy colonies in spring did not differ from that of healthy baseline colony levels in fall suggesting spring prevalence level would not be a useful metric for diagnosis of factors contributing to colony loss. Sacbrood virus was the only virus that was more prevalent in unhealthy colonies from Manitoba, Canada than in healthy from colonies across Canada but did not differ from healthy colonies within Manitoba. Multiple infections were ubiquitous with a few colonies having simultaneous infection with as many as five viruses. Among the three viruses quantified by qPCR, DWV had the highest relative concentrations in pooled samples of worker bees. Deformed wing virus was the only virus within healthy colonies that differed in fall concentration among provinces and was at high levels in unhealthy colonies. Black queen cell virus was positively correlated with IAPV across all samples. Our study provides the first major baseline study of viruses in Canadian honey bees.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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