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Enregistrement W2605325696 · doi:10.1200/jco.2017.35.8_suppl.179

The implementation of a streamlined process for biomarker testing in medical oncology.

2017· article· en· W2605325696 sur OpenAlexaffabout
Laavanya Dharmakulaseelan, Tanya Jorden, Bryan B. Franco, Janice Stewart, Gail Sanders, Patrice Boulianne, Karen Laws, Matthew C. Cheung, Simron Singh, Nadia Ismiil, Maureen Trudeau

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEconomics, Econometrics and Finance
ThématiqueEconomic and Financial Impacts of Cancer
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBiomarkerUploadDocumentationTest (biology)ReceiptRequisitionMedical physicsComputer scienceWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

179 Background: Biomarker testing is increasingly becoming an essential part of standard care. At Sunnybrook Health Sciences Centre (SHSC) in Toronto, Canada, our Department of Molecular Services handles some internal biomarker tests, while some tests are referred to citywide labs. The Odette Cancer Centre (OCC) of SHSC is one of the largest cancer centres in Canada, serving over 12,000 new patients per year, of whom many rely on biomarker tests for personalized treatment. We aimed to describe the work systems at the OCC for biomarker testing and reporting, and to initiate system improvements. Methods: This quality improvement initiative occurred in three phases: qualitative descriptive analysis of the current process of biomarker testing, exploration of future state process using LEAN, and implementation of a streamlined process. In phase one, ten medical oncologists, two administrative assistants, and one pathologist were interviewed. A multidisciplinary team was then assembled to investigate and initiate improvements. Results: Tracking results from external labs was managed by individual physicians and hard copy results were submitted to medical records for filing in patient paper charts, compared to internal tests which are posted on the electronic record, making outside tests harder to retrieve later. The current process involved more than 150 different tests with only 44% of results appearing in the hospital electronic record. In June 2016, a standardized process was implemented where a designated laboratory assistant managed requisition forms, sent corresponding specimens to qualified labs, ensured the receipt of results through various electronic tracking tools and validated the subsequent upload to the electronic medical system. Over a four-month implementation period, there were 364 cases/patients with 467 tests requested; 100% of these test results are stored in the electronic record. Conclusions: The lack of standardization of biomarker testing and reporting can have negative implications on quality of care and patient safety. Therefore, streamlining this process and incorporating electronic tracking tools can improve the accessibility of test results to improve the quality of oncology care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,117
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,093
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,617

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1170,093
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0060,004
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0030,008
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,300
Tête enseignante GPT0,530
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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