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Enregistrement W2605369615 · doi:10.1073/pnas.1617728114

Parallel adaptive evolution of geographically distant herring populations on both sides of the North Atlantic Ocean

2017· article· en· W2605369615 sur OpenAlexafffund
Sangeet Lamichhaney, Angela P. Fuentes‐Pardo, Nima Rafati, Nils Ryman, Gregory R. McCracken, Christina Bourne, Rabindra Singh, Daniel E. Ruzzante, Leif Andersson

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceScience for Life LaboratoryUppsala UniversitetVetenskapsrådetHospital for Sick ChildrenNorges ForskningsrådKillam TrustsSvenska Forskningsrådet Formas
Mots-clésBiologyAdaptation (eye)HerringEvolutionary biologyNorth Atlantic oscillationEcologyGeographyFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Identification of genetic changes that allow a species to adapt to different environmental conditions is an important topic in evolutionary biology. In this study we analyzed whole-genome resequencing data of Atlantic herring populations from both sides of the Atlantic Ocean and identified a number of loci that show consistent associations with spawning time (spring or autumn). Several of these loci, such as thyroid-stimulating hormone receptor ( TSHR ), have a well-established role in reproductive biology, whereas others have never been implicated in controlling reproduction. Genetic variants associated with adaptation to spring or autumn spawning are shared to a large extent among populations across the Atlantic Ocean and the Baltic Sea, providing evidence for parallel adaptive evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,277

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations158
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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