Calmodulin as a Ca2+-Sensing Subunit of Arabidopsis Cyclic Nucleotide-Gated Channel Complexes
Notice bibliographique
Résumé
Ca2+ serves as a universal second messenger in eukaryotic signaling pathways, and the spatial and temporal patterns of Ca2+ concentration changes are determined by feedback and feed-forward regulation of the involved transport proteins. Cyclic nucleotide-gated channels (CNGCs) are Ca2+-permeable channels that interact with the ubiquitous Ca2+ sensor calmodulin (CaM). CNGCs interact with CaMs via diverse CaM-binding sites, including an IQ-motif, which has been identified in the C-termini of CNGC20 and CNGC12. Here we present a family-wide analysis of the IQ-motif from all 20 Arabidopsis CNGC isoforms. While most of their IQ-peptides interacted with conserved CaMs in yeast, some were unable to do so, despite high sequence conservation across the family. We showed that the CaM binding ability of the IQ-motif is highly dependent on its proximal and distal vicinity. We determined that two alanine residues positioned N-terminal to the core IQ-sequence play a significant role in CaM binding, and identified a polymorphism at this site that promoted or inhibited CaM binding in yeast. Through detailed biophysical analysis of the CNGC2 IQ-motif, we found that this polymorphism specifically affected the Ca2+-independent interactions with the C-lobe of CaM. This same polymorphism partially suppressed the induction of programmed cell death by CNGC11/12 in planta. Our work expands the model of CNGC regulation, and posits that the C-lobe of apo-CaM is permanently associated with the channel at the N-terminal part of the IQ-domain. This mode allows CaM to function as a Ca2+-sensing regulatory subunit of the channel complex, providing a mechanism by which Ca2+ signals may be fine-tuned.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».