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Enregistrement W2605673211 · doi:10.1002/lno.10552

Iron and vitamin interactions in marine diatom isolates and natural assemblages of the Northeast Pacific Ocean

2017· article· en· W2605673211 sur OpenAlexafffund
Natalie R. Cohen, Kelsey A. Ellis, Wilton G. Burns, Robert H. Lampe, Nina Schuback, Zackary I. Johnson, Sergio A. Sañudo‐Wilhelmy, Adrian Marchetti

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDivision of Ocean SciencesNational Oceanic and Atmospheric AdministrationUniversity of VictoriaNational Science Foundation
Mots-clésDiatomMicronutrientPhytoplanktonB vitaminsBiologyVitaminSiderophoreCobalaminMethionineBiotinVitamin bBiochemistryNutrientEcologyChemistryVitamin B12GeneAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Trace metals and B‐vitamins play critical roles in regulating marine phytoplankton growth and composition. While some microorganisms are capable of producing certain B‐vitamins, others cannot synthesize them and depend on an exogenous supply. Therefore, external factors influencing vitamin synthesis, such as micronutrient concentrations, alter the extent to which B‐vitamins are available to auxotrophs in surface waters. We examined iron, B7 (biotin) and B12 (cobalamin) dynamics in diatoms through laboratory culture experiments and within natural diatom assemblages present along an iron gradient in the Northeast Pacific Ocean. In laboratory cultures of the diatom Pseudo‐nitzschia granii, biotin synthase (BIOB) expression decreased 2‐fold under iron limitation, suggesting iron status may affect B7 production in diatoms. Additionally in laboratory cultures of the diatom Grammonema cf. islandica, which contains a B12‐independent methionine synthase (METE), a 15‐fold increase in the expression of METE was observed when grown in the absence of B12 with no significant influence of iron status, suggesting METE expression can be driven by B12 status alone. Iron and B‐vitamin amendment experiments with natural diatom assemblages in iron‐limited waters of the Northeast Pacific Ocean provide evidence for vitamin‐associated molecular responses that suggest elevated B7 biosynthesis and the emergence of B12 limitation following iron addition. Furthermore B‐vitamin gene modules comprised of partial and/or complete B‐vitamin biosynthetic pathways in diatoms increased in response to iron addition, including genes potentially involved in the processing of B12 intermediates. Our results indicate that vitamins may play an important role in regulating phytoplankton growth and composition in this region, particularly following natural iron addition events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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