Comparative analysis of granulosa cell gene expression in association with oocyte competence in FSH-stimulated Holstein cows
Notice bibliographique
Résumé
Ovarian stimulation with exogenous FSH followed by FSH withdrawal or 'coasting' is an effective means of increasing the number of oocytes obtainable for the in vitro production of cattle embryos. However, the quality of the oocytes thus obtained varies considerably from one cow to the next. The aim of the present study was to gain a better understanding of the follicular conditions associated with low oocyte developmental competence. Granulosa cells from 94 Holstein cows in a commercial embryo production facility were collected following ovarian stimulation and coasting. Microarray analysis showed 120 genes expressed with a differential of at least 1.5 when comparing donors of mostly competent with donors of mostly incompetent oocytes. Using ingenuity pathway analysis, we revealed the main biological functions and potential upstream regulators that distinguish donors of mostly incompetent oocytes. These are involved in cell proliferation, apoptosis, lipid metabolism, retinol availability and insulin signalling. In summary, we demonstrated that differences in follicle maturity at collection could explain differences in oocyte competence associated with individual animals. We also revealed deficiencies in lipid metabolism and retinol signalling in granulosa cells from donors of mostly incompetent oocytes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».