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Enregistrement W2605720460 · doi:10.1111/cge.13037

<i><scp>WNK1</scp>/<scp>HSN2</scp></i> founder mutation in patients with hereditary sensory and autonomic neuropathy: A Japanese cohort study

2017· article· en· W2605720460 sur OpenAlexaboutno aff
Jun‐Hui Yuan, Akihiro Hashiguchi, Akiko Yoshimura, Norio Sakai, Masanori Takahashi, Takahiro Ueda, Akira Taniguchi, Shigefumi Okamoto, Nobuo Kanazawa, Yuki Yamamoto, Kazumasa Saigoh, Susumu Kusunoki, Masahiro Ando, Yoshihiro Hiramatsu, Yuji Okamoto, Hiroshi Takashima

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésHaplotypeFounder effectGeneticsCohortNonsense mutationMutationMedicineGenotypeCompound heterozygosityPathologicalBiologyGeneInternal medicineMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The clinical and genetic spectrum of hereditary sensory and autonomic neuropathy (HSAN) is still unknown in Japan. We collected a broad cohort of 33 unrelated patients with predominant sensory and/or autonomic dysfunctions, who were referred to our genetic laboratory. A gene panel sequencing targeting 18 HSAN-related genes was performed using a next-generation sequencing system. A recurrent frame shift mutation in the WNK1/HSN2 gene, c.3237_3238insT (p.Asp1080*), was detected in 5 patients. This mutation was homozygous in 4 cases and of a compound heterozygous genotype in 1 case. Geographic and haplotype analysis of all 5 patients suggested a founder event. In addition, a novel heterozygous nonsense variant, c.2615C>G (p.Ser872*), was identified. All the 5 patients presented with severe sensory and autonomic dysfunctions at birth or during adolescence. In 2 patients, an uncommon phenotype of acute pathological pain presented at ~50 years of age. Here, we present the first founder mutation of WNK1/HSN2, in addition to French Canadian, which accounts for ~15.2% of Japanese patients with HSAN in our cohort. We have also reviewed all previously described mutations in WNK1/HSN2 and reconciled their nomenclature strategy on the basis of the current longest transcript.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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