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Enregistrement W2605764624 · doi:10.18632/oncotarget.17124

Discovery and characterization of small molecules targeting the DNA-binding ETS domain of ERG in prostate cancer

2017· article· en· W2605764624 sur OpenAlexafffundabout
Miriam Butler, Mani Roshan‐Moniri, Michael Hsing, Desmond Lau, Ari Kim, Paul Yen, Marta Mroczek, Mannan Nouri, Scott Lien, Peter Axerio-Cilies, Kush Dalal, Clement Yau, Fariba Ghaidi, Yubin Guo, Takeshi Yamazaki, Sam Lawn, Martin Gleave, Cheryl Y. Gregory‐Evans, Lawrence P. McIntosh, Michael Cox, Paul S. Rennie, Artem Cherkasov

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCongressionally Directed Medical Research ProgramsBritish Columbia Knowledge Development FundCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteProstate Cancer FoundationNational Institutes of HealthProstate Cancer CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésProstate cancerErgMedicineCancer researchDNA damageComputational biologyDNAOncologyCancerInternal medicineGeneticsBiologyOphthalmology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Miriam S. Butler 1, *, # , Mani Roshan-Moniri 1, *, # , Michael Hsing 1, *, # , Desmond Lau 2, *, # , Ari Kim 1 , Paul Yen 1 , Marta Mroczek 1 , Mannan Nouri 1 , Scott Lien 1 , Peter Axerio-Cilies 1 , Kush Dalal 1 , Clement Yau 1 , Fariba Ghaidi 1 , Yubin Guo 1 , Takeshi Yamazaki 1 , Sam Lawn 1 , Martin E. Gleave 1 , Cheryl Y. Gregory-Evans 3 , Lawrence P. McIntosh 2, * , Michael E. Cox 1, * , Paul S. Rennie 1, * and Artem Cherkasov 1, * 1 Vancouver Prostate Centre and the Department of Urologic Sciences, University of British Columbia, Vancouver, BC V6H 3Z6, Canada 2 Department of Biochemistry and Molecular Biology, Department of Chemistry, Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z3, Canada 3 Department of Ophthalmology and Visual Sciences, Eye Care Centre, University of British Columbia, Vancouver, BC V5Z 3N9, Canada * These authors contributed equally to this work # Co-first authors Correspondence to: Michael E. Cox, email: mcox@prostatecentre.com Artem Cherkasov, email: acherkasov@prostatecentre.com Keywords: prostate cancer, ERG, rational drug design, small molecule inhibitor, TMPRSS2-ERG Received: July 29, 2016      Accepted: April 04, 2017      Published: April 15, 2017 ABSTRACT Genomic alterations involving translocations of the ETS-related gene ERG occur in approximately half of prostate cancer cases. These alterations result in aberrant, androgen-regulated production of ERG protein variants that directly contribute to disease development and progression. This study describes the discovery and characterization of a new class of small molecule ERG antagonists identified through rational in silico methods. These antagonists are designed to sterically block DNA binding by the ETS domain of ERG and thereby disrupt transcriptional activity. We confirmed the direct binding of a lead compound, VPC-18005, with the ERG-ETS domain using biophysical approaches. We then demonstrated VPC-18005 reduced migration and invasion rates of ERG expressing prostate cancer cells, and reduced metastasis in a zebrafish xenograft model. These results demonstrate proof-of-principal that small molecule targeting of the ERG-ETS domain can suppress transcriptional activity and reverse transformed characteristics of prostate cancers aberrantly expressing ERG. Clinical advancement of the developed small molecule inhibitors may provide new therapeutic agents for use as alternatives to, or in combination with, current therapies for men with ERG-expressing metastatic castration-resistant prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,323
Score d'incertitude au seuil0,218

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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