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Enregistrement W2605764828 · doi:10.1038/s41598-017-01104-9

Limited genomic consequences of hybridization between two African clawed frogs, Xenopus gilli and X. laevis (Anura: Pipidae)

2017· article· en· W2605764828 sur OpenAlexaff
Benjamin L. S. Furman, Caroline M. S. Cauret, Graham A. Colby, John Measey, Ben J. Evans

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesDST-NRF Centre of Excellence for Invasion BiologyHarvard UniversityDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaMuseum of Comparative Zoology, Harvard UniversitySouth African National ParksNational Research FoundationUniversiteit Stellenbosch
Mots-clésIntrogressionBiologyGene flowEndangered speciesZoologySpecies complexHybridPopulationThreatened speciesAfrican clawed frogEcologyRange (aeronautics)Conservation geneticsEvolutionary biologyGenetic variationXenopusHabitatGeneticsGeneMicrosatelliteBotanyAllelePhylogenetic treeDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Cape platanna, Xenopus gilli , an endangered frog, hybridizes with the African clawed frog, X . laevis , in South Africa. Estimates of the extent of gene flow between these species range from pervasive to rare. Efforts have been made in the last 30 years to minimize hybridization between these two species in the west population of X . gilli , but not the east populations. To further explore the impact of hybridization and the efforts to minimize it, we examined molecular variation in one mitochondrial and 13 nuclear genes in genetic samples collected recently (2013) and also over two decades ago (1994). Despite the presence of F 1 hybrids, none of the genomic regions we surveyed had evidence of gene flow between these species, indicating a lack of extensive introgression. Additionally we found no significant effect of sampling time on genetic diversity of populations of each species. Thus, we speculate that F 1 hybrids have low fitness and are not backcrossing with the parental species to an appreciable degree. Within X . gilli , evidence for gene flow was recovered between eastern and western populations, a finding that has implications for conservation management of this species and its threatened habitat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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