MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2605813800 · doi:10.23889/ijpds.v1i1.171

Modelling Diagnostic Validity Estimates from Administrative Health Data

2017· article· en· W2605813800 sur OpenAlexaff
Kristine Kroeker, Lisa M. Lix, Depeng Jiang, Saman Muthukumarana

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Causal Inference Techniques
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStatisticsUnivariateBivariate analysisConfidence intervalYouden's J statisticMean squared errorMathematicsSensitivity (control systems)Complement (music)Variance (accounting)RegressionCorrelationRegression analysisStandard errorEconometricsMultivariate statistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT ObjectivesValidation studies compare diagnostic information in linked administrative and reference (i.e., gold standard) data; they are an essential tool to develop accurate case definitions, the rules used to identify individuals in administrative data with a specific health condition. Validation studies often estimate the accuracy of multiple case definitions, in order to identify the data features (e.g., diagnosis codes, type of data source) that influence accuracy estimates. Descriptive analyses are commonly used to select a case definition(s) with the greatest accuracy estimates, but fail to account for uncertainty in accuracy estimates. The objectives were to: (1) compare the performance of regression-based approaches to test for differences in diagnostic accuracy estimates, and (2) demonstrate how to apply and use these models. ApproachComputer simulation was used to compare three regression models: (a) univariate fixed-effects models applied to estimates of sensitivity and specificity; (b) univariate fixed-effects model for Youden's index, the average of sensitivity and the complement of specificity; and (c) bivariate random-effects joint model of sensitivity and specificity. The simulations varied the means and variances of sensitivity and specificity, the correlation between these parameters, and the number of case definitions. Performance was compared using: (a) bias (i.e., difference between estimated and observed mean), (b) mean squared error (MSE), the sum of the estimated variance and bias squared, and (c) 95% confidence interval (CI) coverage, the proportion of times the population mean is contained in the 95% CI. For objective 2, we applied the models to estimates of diagnostic accuracy from a published rheumatoid arthritis (RA) validation study with 61 case definitions. ResultsUnivariate models of sensitivity and specificity had lower bias than the bivariate model (e.g., univariate=1.8%, bivariate=2.2%). The bivariate model had a smaller MSE than the univariate models when sample size was large and there was a small correlation between sensitivity and specificity (e.g., univariate=3.4%, bivariate=2.6%). Across all scenarios, the univariate model for Youden’s index showed small bias (average=2.4%) and MSE (average=2.1%). For objective 2, the univariate models of sensitivity, specificity, and Youden’s index revealed multiple case definition features that were associated with estimates of RA diagnostic accuracy: 1+ diagnosis in hospital records, >1 diagnosis in physician claims, and 1+ diagnoses by a specialist physician. ConclusionsWe recommend the bivariate model when a validation study contains a large number of case definitions. When the data contain a small number of case definitions, univariate models are recommended.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,078
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,269
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0780,269
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,783
Tête enseignante GPT0,618
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal for Population Data ScienceMême sujetAdvanced Causal Inference TechniquesTravaux en français237 207