Distribution of Dehalococcoides 16S rRNA and Dehalogenase Genes in Contaminated Sites
Notice bibliographique
Résumé
Understanding the spatial distribution of Dehalococcoides and its reductive dehalogenase genes in sediment is important for bioremediation of sites contaminated with chlorinated ethylenes. A total of 56 sediment samples were collected from four contaminated sites in Japan, and quantified copies of Dehalococcoides 16S rRNA and reductive dehalogenase genes: tceA, bvcA, and vcrA, as well as chlorinated ethylenes. Dehalococcoides was detected from 22 sediment samples with various geological formations, textures and saturation conditions. The detected Dehalococcoides 16S rRNA gene ranged from 6.4 × 102 to 2.5 × 107 copies g−1. In the 22 samples, the dehalogenase genes: tceA, bvcA, and vcrA were contained 1.4 × 103 to 1.6 × 104, 1.0 × 103 to 2.0 × 105, and 2.7 × 102 to 8.5 × 105 copies g−1, respectively. Statistical analysis revealed that the distribution of dehalogenase genes depends on site and depth, but not existence of vinyl chloride. To estimate potential for bioremediation of contaminated sites, quantification of dehalogenase genes according to sediment depth is important and thus recommended.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».