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Enregistrement W2606138828 · doi:10.1055/s-0037-1601449

Genetic, Phenotypic, and Interferon Biomarker Status in ADAR1-Related Neurological Disease

2017· article· en· W2606138828 sur OpenAlexaff
Gillian Rice, Naoki Kitabayashi, Magalie Barth, Tracy A. Briggs, Annabel Burton, Maria Luisa Carpanelli, Alfredo Cerisola, Cindy Colson, Russell C. Dale, Federica Rachele Danti, Niklas Darín, Begoña De Azua, Valentina De Giorgis, Christian De Goede, Isabelle Desguerre, Corinne De Laet, Atieh Eslahi, Michael Fahey, Penny Fallon, Alex J. Fay, Elisa Fazzi, Mark Gorman, Nirmala Gowrinathan, Marie Hully, Manju A. Kurian, Nicolas Leboucq, Jean‐Pierre Lin, Matthew A. Lines, Soe Mar, Reza Maroofian, Laura Martí‐Sánchez, Gary McCullagh, Majid Mojarrad, Vinodh Narayanan, Simona Orcesi, Juan Darío Ortigoza‐Escobar, Belén Pérez‐Dueñas, Florence Petit, Keri Ramsey, Magnhild Rasmussen, François Rivier, Pilar Rodríguez‐Pombo, Agathe Roubertie, Tommy Stödberg, Mehran Beiraghi Toosi, Annick Toutain, Florence Uettwiller, Nicole Ulrick, Adeline Vanderver, Amy Waldman, John H. Livingston, Yanick J. Crow

Notice bibliographique

RevueNeuropediatrics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeAgence Nationale de la RechercheRosetrees TrustMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésMissense mutationMedicinePhenotypeInterquartile rangeCompound heterozygosityContext (archaeology)Internal medicineGeneticsPathologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We investigated the genetic, phenotypic, and interferon status of 46 patients from 37 families with neurological disease due to mutations in ADAR1. The clinicoradiological phenotype encompassed a spectrum of Aicardi–Goutières syndrome, isolated bilateral striatal necrosis, spastic paraparesis with normal neuroimaging, a progressive spastic dystonic motor disorder, and adult-onset psychological difficulties with intracranial calcification. Homozygous missense mutations were recorded in five families. We observed a p.Pro193Ala variant in the heterozygous state in 22 of 23 families with compound heterozygous mutations. We also ascertained 11 cases from nine families with a p.Gly1007Arg dominant-negative mutation, which occurred de novo in four patients, and was inherited in three families in association with marked phenotypic variability. In 50 of 52 samples from 34 patients, we identified a marked upregulation of type I interferon-stimulated gene transcripts in peripheral blood, with a median interferon score of 16.99 (interquartile range [IQR]: 10.64–25.71) compared with controls (median: 0.93, IQR: 0.57–1.30). Thus, mutations in ADAR1 are associated with a variety of clinically distinct neurological phenotypes presenting from early infancy to adulthood, inherited either as an autosomal recessive or dominant trait. Testing for an interferon signature in blood represents a useful biomarker in this context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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