CNSS Chair’s Select Abstract Presentations
Notice bibliographique
Résumé
Background: The hedgehog pathway (Hh) is an important developmental signaling pathway that is commonly dysregulated in brain tumors, most notably in medulloblastomas. To identify novel therapeutic targets within the Hh pathway, we performed the first quantitative proteome-wide evaluation of phosphorylation events resulting from in vitro SHH administration and occurring throughout Hh-driven cerebellar development in vivo. Methods: Multiplexed quantitative mass spectrometry was done using Tandem Mass Tags 10-plex reagents, TiO2 phosphopeptide enrichment and HPLC-MS/MS/MS. Results: Motif analysis of 2-fold changing phosphorylation events suggested casein kinase 2 (CK2) was responsible for mediating 45% of all changes in phosphorylation. Epistasis studies revealed that CK2 activity is necessary for hedgehog signaling and affects terminal signaling components, thereby circumventing challenges of emergence of resistance and a priori resistance that are commonly encountered with existing small molecule inhibitors in medulloblastoma. In vivo, mice harboring MB allografts resistant to current therapies showed near-complete cessation of tumor growth in response to a CK2 inhibitor. Conclusion: Our use of developmental phosphoproteomics revealed casein kinase 2 as a key regulator of hedgehog signaling and therapeutic target in medulloblastoma. Our success establishes a foundation for us, and others, to apply a similar approach in different tumor initiating pathways.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,688 | 0,419 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».