4. “Biphasic” histology is associated with the non-WNT/SHH molecular subtype of medulloblastoma
Notice bibliographique
Résumé
Introduction In 2007, Ellison et al coined the term “biphasic” medulloblastoma (B-MB) to characterize histology that mimicked the desmoplastic nodular (DN) variant on routine staining, but which lacked internodular reticulin deposition. Via interphase FISH, and utilizing markers for 9q22 and chromosome 17 alterations (ie, -17p and i17q), Ellison et al. suggested that B-MB and DN-MB were genetically different. Methods We performed a clinicopathologic review of MBs treated at BCCH from 1986-2011. Using nanoString’s n Counter Analysis System (nCAS), each tumor was molecularly subtyped (ie, WNT, SHH, group 3 or group 4). All original glass slides were reviewed to determine WHO histologic subtype [ie, classic, large cell anaplastic (LCA), DN, MB with extensive nodularity (MBEN)]. Tumors were also evaluated for nodularity (scattered vs. frequent) and advanced neuronal differentiation. Reticulin staining was assessed on all cases. Results 20 B-MB were identified; by WHO definition, most of these resided within the classic category (N=19), while one was LCA. 13 of 20 B-MB displayed ‘scattered” nodules; by molecular subtype, these included eight group 4, four group 3 and one WNT tumors. Seven of the 20 B-MB exhibited “frequent” nodules; by molecular subtype, these included six group 4 and one group 3 tumors. Statistical analysis confirmed this non random distribution of B-MB across molecular subtypes. Conclusion Our data confirm the work of Ellison et al. that suggested B-MB is genetically different than DN-MB. In particular, B-MB resides in the non-WNT/SHH molecular category, but especially amongst group 4 when nodularity is “frequent”.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».