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Enregistrement W2607239810 · doi:10.1007/s12275-017-6592-3

Corynebacterium defluvii sp. nov., isolated from Sewage

2017· article· en· W2607239810 sur OpenAlexaff
Qiu-Li Yu, Zheng‐Fei Yan, Xin He, Fenghua Tian, Chuanwen Jia, Changtian Li

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensMinistry of Education and Child Care
Organismes subventionnairesPeople's Government of Jilin Province
Mots-clésCorynebacteriumCorynebacterium glutamicum16S ribosomal RNABiologyPeptidoglycanDiamino acidMicrobiologyStrain (injury)ArabinoseBacteriaPhylogenetic treeBiochemistryCell wallHalophileGeneFermentationXyloseGeneticsGene sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A Gram-positive, aerobic, non-motile, rod-shapeds, catalase-positive, and oxidase-negative strain, designated Y49T, was isolated from sewage collected from Jilin Agricultural University, China. It grew at 20–40°C (optimum at 30°C), at pH 6.0–8.0 (optimum at 7.0) and at 0–1.0% sodium chloride (optimum at 0%). The major isoprenoid quinone was menaquinone-8 (MK-8) and the polar lipids were diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylmethylethanolamine, four unidentified lipids, and two unidentified aminolipids. The peptidoglycan was meso-diaminopimelic acid. The cell-wall sugars were galactose, arabinose, and glucose. The fatty acids were C9:0, C16:0, C16:1 ω9c, C17:1 ω9c, C18:3 ω6c (6,9,12), C18:1 ω9c, and C18:0. The DNA G+C content was 51.4 mol%. Based on the 16S rRNA gene sequence analysis, the nearest phylogenetic neighbors of strain Y49T were Corynebacterium efficiens DSM 44549T (97.5%), Corynebacterium callunae DSM 20147T (97.2%), Corynebacterium deserti GIMN 1.010T (96.8%), Corynebacterium glutamicum ATCC 13032T (96.4%), and other species belonging to this genus (92.3–95.4%). The DNA-DNA relatedness value between strain Y49T and C. efficiens DSM 44549T, C. callunae DSM 20147T, C. deserti GIMN1.010T, and C. glutamicum ATCC 13032T was 25.5±2.0%, 21.1±1.0%, 16.5±0.5%, and 13.5±0.9%, respectively. Based on the phylogenetic analysis, chemotaxonomic data, physiological characteristics and DNA-DNA hybridization data, strain Y49T represents a novel species of the genus Corynebacterium, for which the name Corynebacterium defluvii sp nov. is proposed. The type strain is Y49T (= KCTC 39731T =CGMCC 1.15506T).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,282
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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