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Enregistrement W2607256899 · doi:10.1534/g3.117.041194

SLC25 Family Member Genetic Interactions Identify a Role for <i>HEM25</i> in Yeast Electron Transport Chain Stability

2017· article· en· W2607256899 sur OpenAlexafffund
Jesica N. Dufay, J. Pedro Fernández-Murray, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesGenome AtlanticGenome Canada
Mots-clésYeastHemeElectron transport chainMitochondrionBiochemistrySaccharomyces cerevisiaeFunction (biology)Sideroblastic anemiaBiologyTransporterFamily memberCell biologyGene familyGeneGeneticsChemistryEnzymeGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The SLC25 family member SLC25A38 (Hem25 in yeast) was recently identified as a mitochondrial glycine transporter that provides substrate to initiate heme/hemoglobin synthesis. Mutations in the human SLC25A38 gene cause congenital sideroblastic anemia. The full extent to which SLC25 family members coregulate heme synthesis with other mitochondrial functions is not clear. In this study, we surveyed 29 nonessential SLC25 family members in Saccharomyces cerevisiae for their ability to support growth in the presence and absence of HEM25. Six SLC25 family members were identified that were required for growth or for heme synthesis in cells lacking Hem25 function. Importantly, we determined that loss of function of the SLC25 family member Flx1, which imports FAD into mitochondria, together with loss of function of Hem25, resulted in inability to grow on media that required yeast cells to supply energy using mitochondrial respiration. We report that specific components of complexes of the electron transport chain are decreased in the absence of Flx1 and Hem25 function. In addition, we show that mitochondria from flx1Δ hem25Δ cells contain uncharacterized Cox2-containing high molecular weight aggregates. The functions of Flx1 and Hem25 provide a facile explanation for the decrease in heme level, and in specific electron transport chain complex components.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,532
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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